企業補單被查，妳的公司要補足歷年補單稅額。企業補單屬於違法行為，被查到要罰款20-200萬不等。企業的補單行為將被計入工信部，以後妳的客戶打開妳的公司，就能查到妳的處罰信息，並且妳的企業在貸款的時候，也會受到阻礙。