組合貸款只適合連續足額繳存公積金的購房者，因為此項貸款中涉及到公積金貸款，所以對適用對象有壹定的限制。
2、商業貸款與公積金貸款期限必須壹致
大多數銀行要求，申請組合貸款的借款人，設定貸款期限時，商業貸款與公積金貸款期限必須壹致，因為這樣銀行才好處理抵押物。
3、提前還款應先還商業貸款
申請了組合貸款的客戶，若想提前還款，那麽最好先還商業貸款，因為此項貸款的利率比公積金貸款利率高，這樣可以節省貸款成本。
4、程序上條件制約
辦理的銀行必須由公積金管理中心指定，使得購房人在選擇銀行、貸款產品以及還款方式上存在壹定程度的制約。
5、組合貸款的辦理時間較長，流程較復雜
因為組合貸同時涉及到公積金與商業兩種貸款，所以需要進行兩遍審核程序，而商業貸款部分需要抵押登記後銀行見他項權利證才能放款，這也使得組合貸在辦理流程上比純商貸與純公積金時間更長，造成很多業主對這種貸款方式的接受程度低，而且在貸款辦理的費用方面，由於組合貸款需要分開收取公積金與商業貸款的服務費，所以和商業貸款相比，借款人在辦理組合貸時可能會增加費用支出。
申請組合貸款的流程
1、提出借款申請：借款人持購房合同和開發商售房許可證復印件、身份證、住房公積金儲蓄磁卡、印章到各區縣的建行房地產信貸部申請住房公積金貸款(使用夫妻雙方住房公積金貸款的，還須攜帶結婚證或其他夫妻關系證明)，填寫“個人住房公積金貸款(組合)貸款申請書”。
2、銀行審核：貸款銀行根據借款人提供的資料，考核借款人是否符合貸款條件，計算貸款額度，確定貸款期限。
3、簽訂借款合同：貸款銀行審核借款人的申請後,借款人與銀行簽訂借款合同和抵押合同(不用房屋擔保的簽訂質押合同)。
4、辦理貸款擔保手續：辦理住房公積金貸款(組合貸款)有兩種擔保方式，借款人可以根據自己的實際情況選擇其中的任何壹種。可用自有、***有或第三人房產進行抵押，還可用國債、銀行定期存單等貸款銀行認可的有價證券進行質押，借款人持有價證券交貸款銀行收押保管。
5、辦理住房抵押保險手續：借款人到產權部門辦理完抵押或質押手續後,連同借款合同、抵押合同(質押合同)、房屋他項權證、抵押權證明書等借款資料交貸款銀行辦理房屋保險手續。
6、簽訂還款協議和劃款：采用儲蓄卡代扣方式還款的,借款人到建行儲蓄網點辦理還款代扣儲蓄卡，並與貸款銀行簽訂代扣協議。委托單位代扣還款的，單位與貸款銀行簽訂協議。
7、銀行劃款：借款人按與貸款銀行約定的時間到貸款銀行辦理領款手續,貸款銀行將款項劃入售房單位；用於修、建房的貸款,借款人按借款合同支取。