但根據新政策，只要貸款買房，無論是否還清抵押貸款，使用商業貸款還是公積金貸款，只要貸款記錄，再次申請住房貸款，按照第二套抵押貸款標準執行。
2023年南京二套房的購房政策在地區、貸款、公積金幾方面進行了更新。
申請第二套住房貸款，至少需要支付40%的首付。如果某人有壹套房子，但沒有貸款記錄，或者已經還清了抵押貸款，那麽在六合區再次購買第二套房子的最低首付是35%；如果在南京高淳區和溧水區買了第二套房子，最低首付是30%；南京市主城區8區購買第二套房，最低首付比例為50%。
根據規定，在南京註冊的家庭最多可以購買兩套住房。根據最新的政策，南京六合區、高淳區、溧水區也被納入其他戶籍限制範圍。在其他地方註冊的人只能在南京買壹套房子。
如果第壹套住宅的房貸還清，申請購買第二套住宅貸款，如果在六合區購買，首付最低為50%；在南京高淳區、溧水區購買第二套住宅，首付最低為40%；南京市主城區8區購買第二套住宅，最低首付比例為80%。
如果想申請公積金購買兩套住宅，居住的第壹套住宅家庭的人均住宅面積需要低於32%，貸款已經還清，才能申請公積金購買兩套住宅，最低首付比例為30%。
綜上所述，申請第二套住房貸款，至少需要支付40%的首付。
法律依據：
《不動產登記暫行條例》 第七條
不動產登記由不動產所在地的縣級人民政府不動產登記機構辦理；直轄市、設區的市人民政府可以確定本級不動產登記機構統壹辦理所屬各區的不動產登記。跨縣級行政區域的不動產登記，由所跨縣級行政區域的不動產登記機構分別辦理。不能分別辦理的，由所跨縣級行政區域的不動產登記機構協商辦理；協商不成的，由***同的上壹級人民政府不動產登記主管部門指定辦理。
《中華人民***和國城市房地產管理法》 第六十條
房地產轉讓或者變更時，應當向縣級以上地方人民政府房產管理部門申請房產變更登記，並憑變更後的房屋所有權證書向同級人民政府土地管理部門申請土地使用權變更登記，經同級人民政府土地管理部門核實，由同級人民政府更換或者更改土地使用權證書。法律另有規定的，依照有關法律的規定辦理。