1.公積金還款是否是從公積金賬戶中扣除主要是看用戶的選擇,公積金貸款每月還款可以從公積金賬戶扣除,也可從銀行的儲蓄賬戶中扣款。公積金貸款指繳存住房公積金的職工享受的貸款,凡是繳存公積金的職工均可按公積金貸款的相關規定申請公積金貸款。
2.公積金貸款每月還款不壹定從公積金扣，分為以下幾種情況：
（1）如果借款人辦理了公積金月沖業務，那麽公積金貸款還款是公積金貸款每月還款是從公積金扣的，公積金月沖指的是貸款銀行每個月從借款人的公積金賬戶中扣除余額用來償還公積金貸款。
（2）如果借款人辦理了公積金年沖業務，那麽公積金貸款還款是公積金貸款每月還款不是從公積金扣的，年沖指的是銀行每年壹次性從借款人的公積金賬戶中扣除余額用來償還公積金貸款。
（3）如果借款人沒有辦理公積金對沖業務，那麽不會扣公積金。
3.公積金貸款指繳存住房公積金的職工享受的貸款。國家規定，凡是繳存公積金的職工均可按公積金貸款的相關規定申請公積金貸款。按規定繳存住房公積金壹定期限以上（各城市的期限不同，如長沙為12個月以上）的在職職工為購建住房、翻建、大修自有住房資金不足時可申請公積金貸款。
法律依據
《住房公積金管理條例》第二十六條規定， 繳存住房公積金的職工，在購買、建造、翻建、大修自住住房時，可以向住房公積金管理中心申請住房公積金貸款。住房公積金管理中心應當自受理申請之日起15日內作出準予貸款或者不準貸款的決定，並通知申請人；準予貸款的，由受委托銀行辦理貸款手續。住房公積金貸款的風險，由住房公積金管理中心承擔。
《個人所得稅專項附加扣除暫行辦法》第十四條 納稅人本人或者配偶單獨或者***同使用商業銀行或者住房公積金個人住房貸款為本人或者其配偶購買中國境內住房，發生的首套住房貸款利息支出，在實際發生貸款利息的年度，按照每月1000元的標準定額扣除，扣除期限最長不超過240個月。納稅人只能享受壹次首套住房貸款的利息扣除。
本辦法所稱首套住房貸款是指購買住房享受首套住房貸款利率的住房貸款。
根據《個人所得稅專項附加扣除暫行辦法》，納稅人本人或者配偶單獨或者***同使用商業銀行或者住房公積金個人住房貸款為本人或者其配偶購買中國境內住房，發生的首套住房貸款利息支出；在實際發生貸款利息的年度，按照每月1000元的標準定額扣除，扣除期限最長不超過240個月。