1、主要目標群體不同：網商銀行：網商銀行確定是壹家為小企業服務的銀行，主攻貸款不超過500萬元。同時也可以說明，小微企業、個人消費者和農村用戶，是網商銀行的目標客戶群體。微眾銀行：微眾銀行主要定位於向用戶提供購物、旅行等個人消費金融服務。同時微眾銀行沒有PC端業務網站，反而更加註重移動端。
2、主要業務內容差別：網商銀行：活期分為真活期和余利寶，真活期年化0.42%，而余利寶年化2%左右，是天弘基金的壹個貨基，跟余額寶不盡相同。微眾銀行：活期是國金眾贏貨幣基金，年化3%左右，是國金基金專為微眾銀行打造的，活期余額可以實時轉出，每天限額300萬。活期余額還可以用來投資微眾銀行裏的其他產品。
3、團隊對比：網商銀行：據媒體報道2/3的員工是數據建模人員。微眾銀行：據媒體報道40%的員工來自騰訊的互聯網產品開發人員。
4、與傳統銀行之關系：網商銀行：自營+平臺模式，壹頭連接著小微企業的資金需求，另壹頭則有包含壹系列傳統銀行在內的資金供給方，並已和保險、信托等機構洽談合作。微眾銀行：已展開與傳統銀行的同業合作，與華夏銀行等銀行簽署合作協議，開展包括同業授信、***同發放小額貸款、聯名發信用卡、代售理財產品等多項合作。