1、科目要素不同
利息屬於損益類科目；而手續費屬於資產類科目。
2、核算的內容不同。
財務費用的利息支出，指企業短期借款利息、長期借款利息、應付票據利息、票據貼現利息、應付債券利息、長期應付引進國外設備款利息等利息支出（除資本化的利息外）減去銀行存款等的利息收入後的凈額。
手續費是指短期債券投資實際支付的價款中包含的已到付息期但尚未領取的債券利息。這部分應收利息不計入短期債券投資初始投資成本中。但實際支付的價款中包含尚未到期的債券利息，則計入短期債券投資初始投資成本中不需要單獨核算的部分。
3、業務分錄不同
財務費用和應收利息是不同的賬務處理方式，需要根據情況不同分別使用的科目。利息收入最終應計入財務費用，在會計權責發生制原則下，對於歸屬當期的利息收入，如果沒有當期收到，則用應收利息科目歸集。
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