在FAT32文件系統推出之前，PC通常使用的文件系統是FAT16。基於MS-DOS和Win 95的系統都采用FAT16文件系統。在Win 9X下，FAT16支持的最大分區是2GB。我們知道計算機將信息存儲在硬盤上壹個叫做“簇”的區域。使用的簇越小，保存信息的效率越高。在FAT16的情況下，分區越大，集群就越大，存儲效率就越低，必然造成存儲空間的浪費。而且隨著計算機硬件和應用的不斷提高，FAT16文件系統已經不能滿足系統的要求。在這種情況下，引入了增強的文件系統FAT32。與FAT16相比，FAT32具有以下特點:
1.與FAT16相比，FAT32最大的優勢是可以支持2TB(2047GB)的磁盤大小，但不支持小於512MB的分區。基於FAT32的Win 2000可支持最高32GB的分區；；而基於FAT16的Win 2000支持最大4GB的分區。
2.由於采用了更小的集群，FAT32文件系統可以更高效地保存信息。比如兩個分區大小為2GB，壹個分區采用FAT16文件系統，另壹個分區采用FAT32文件系統。使用FAT16的分區的簇大小是32KB，而FAT32分區的簇大小只有4KB。這樣FAT32的存儲效率比FAT16高很多，壹般可以提高15%。
3.FAT32文件系統可以重定位根目錄，並使用FAT的備份副本。此外，FAT32分區的啟動記錄包含在壹個包含關鍵數據的結構中，降低了計算機系統崩潰的可能性。
1.NTFS支持文件加密和單獨管理功能(即著名的EFS加密格式)，可以為用戶提供更高級別的安全保障。
2.NTFS具有更好的磁盤壓縮性能，可以進壹步滿足小硬盤用戶的需求(讀取會比較慢)。NTFS支持最大2 TB (1 TB = 1024 GB)的大硬盤，性能不會隨著磁盤容量的增加而下降。由此可見，NTFS格式有很多獨特的優點，但是，呵呵，它也有壹個缺點，就是磁盤文件格式不能被除自己之外的其他操作系統識別(NT 4.0也不例外)，對數據通信有壹定影響，不支持DOS操作系統，但還是值得支持的。因此...只使用Windows 2000的用戶最好先使用NTFS格式，如果同時使用Windows 2000和其他操作系統，就要慎重了。最好將磁盤分成幾個不同的磁盤分區，將Windows 2000安裝到其中壹個分區，並選擇使用NTFS格式。將其他操作系統安裝到另壹個磁盤分區，並使用FAT或FAT32格式。
NTFS文件系統(下文詳述)NTFS文件系統是壹種基於安全的文件系統，是Windows NT采用的壹種獨特的文件系統結構。它是壹種基於保護文件和目錄數據、節省存儲資源和減少磁盤占用的高級文件系統。廣泛使用的Windows NT 4.0使用的是NTFS 4.0文件系統(以下是5.0，抱歉，哈哈)。相信它帶來的強大的系統安全性壹定給廣大用戶留下了深刻的印象。Win 2000采用了NTFS文件系統的更新版本NTFS 5.0，它的推出使用戶不僅可以像Win 9X壹樣方便地操作和管理計算機，還可以享受NTFS帶來的系統安全性。
1.NTFS可以支持2TB大小的分區(如果使用動態磁盤，則稱為卷)。Win 2000中的FAT32支持最大大小為32GB的分區。
2.2.NTFS是壹個可恢復的文件系統。用戶很少需要在NTFS分區上運行磁盤修復程序。NTFS通過使用標準的事務日誌和恢復技術來確保分區的壹致性。當系統出現故障時，NTFS使用日誌文件和檢查點信息來自動恢復文件系統的壹致性。
3.NTFS支持分區、文件夾和文件的壓縮。任何基於Windows的應用程序在NTFS分區上讀寫壓縮文件時，都沒有必要先用其他程序解壓縮。讀取文件時，文件會自動解壓縮。文件在關閉或保存時會自動壓縮。
4.NTFS使用較小的群集，可以更有效地管理磁盤空間。以Win 2000的FAT32文件系統為例，分區大小為2 GB ~ 8 GB時，簇大小為4kb；分區大小為8 GB ~ 16 GB時，簇大小為8kb；當分區大小為16GB ~ 32GB時，集群大小達到16KB。在Win 2000的NTFS文件系統中，當分區大小低於2GB時，簇大小小於對應的FAT32簇。當分區大小在2GB (2 GB ~ 2 TB)以上時，集群大小為4KB。相比之下，NTFS可以比FAT32更有效地管理磁盤空間，最大限度地避免磁盤空間的浪費。
在NTFS分區上，您可以設置* * *共享資源、文件夾和文件的訪問權限。權限設置包括兩個方面:壹是允許哪些組或用戶訪問文件夾、文件和* * *資源；第二個是什麽級別的訪問組或用戶可以擁有。訪問權限的設置不僅適用於本地計算機的用戶，也適用於通過網絡上的* * *共享文件夾訪問文件的網絡用戶。相比訪問FAT32文件系統下的文件夾或文件，安全性要高很多。此外，在NTFS格式的Win 2000中，可以通過應用審核策略來審核文件夾、文件和active directory對象，審核結果記錄在安全日誌中。通過安全日誌，我們可以看到哪些組或用戶在什麽級別對文件夾、文件或active directory對象進行了操作，從而發現系統可能面臨的非法訪問，並采取相應的措施將這種安全風險降到最低。這些在FAT32文件系統下是無法實現的。
6.磁盤配額管理可以在Win 2000的NTFS文件系統下進行。磁盤配額是指管理員可以限制用戶可以使用的磁盤空間，每個用戶只能在最大配額內使用磁盤空間。設置磁盤配額後，可以跟蹤和控制每個用戶的磁盤使用情況，通過監控識別超過配額告警閾值和配額限制的用戶，從而采取相應的措施。通過提供磁盤配額管理功能，管理員可以方便合理地為用戶分配存儲資源，避免因磁盤空間使用失控而可能導致的系統崩潰，提高系統的安全性。
7.NTFS使用“更改”日誌來跟蹤記錄文件中發生的更改。