1）同壹企業簽訂來料、進料加工兩種不同的貿易性質的合同，余料只能在同貿易性質的合同內結轉，即來料加工合同的余料不得轉入進料加工合同，反之亦然。
2）余料結轉應以本廠帳冊、倉庫實存數量為依據，如實申請，不應為平衡核銷數字虛報余料數量。
3）沒有成品出口的合同，其進口料件不能結轉，壹般按壹般貿易辦理征稅內銷手續或做退運處理。
4）深加工結轉貨物須經轉入、轉出地海關同意後（申請關封後）方可開展實際結轉。深加工結轉貨物未經海關批準不可以擅自送貨，現時企業執行手冊經常出現進出時間倒掛（先出後進）
5）合同只能在有效期內結轉進出；核銷期內只能用於核銷，不能結轉進出。
6）如果成品或半成品結轉（轉出）到關區外（其它關區）企業深加工出口時，要留意轉入企業有否到海關辦理手續、其提供的結轉出口報關單是否作假？以免被轉入企業以假報關單蒙騙，造成麻煩和經濟損失。