但是，我們必須清醒地認識到，蜜月期的愛情不是永恒的愛情，營改增的“減負”只是暫時的。以房地產為例。改革前營業稅稅率為5%，改革後增值稅稅率為1/1.05*5%=4.76%，稅負確實有所下降，下降幅度為4.8%。原因是由於計稅依據由含稅收入改為免稅收入，同時過渡期老項目享受了簡易計稅按5%計稅的臨時優惠，稅負降低了。
當新舊項目過渡期結束，減稅的蜜月期也將結束。而是改革後的新項目按11%的增值稅稅率計算。由於資金利息、人工成本、砂、石、混凝土、零星材料等抵扣不足，大部分拿不到增值稅進項發票。因此，營改增後金融業和現代服務業稅負可能不會增加太多，但建築業稅負至少增加2%，壹二線城市高價城市房地產稅負至少增加3%(含城建稅和教育費附加)。建築、服務和房地產的稅負成本上升，將直接導致房價上漲和生活成本的進壹步增加，因此勞動者將要求更高的工資，勞動力成本的整體上升最終將影響中國實體經濟的全球競爭力和外匯收支平衡。服務業為了降低稅負，通常會把壹個大公司分成幾個小公司，不利於公司規模和實力的擴大，影響我們與國際同行的競爭和評價。
房地產是用來住的，不是用來炒的。房地產和建築行業稅負成本上升，間接導致勞動力成本上升，這不是我們的訴求。根據我們的研究，建築行業的人工成本占銷售額的25%-30%；在低端和傳統制造業，雖然不同行業和公司的利潤水平略有不同，但人工成本占銷售額的比例平均高達20%-40%。在現行的增值稅抵扣鏈條中，不允許抵扣人工成本。雖然有些企業可以通過勞務派遣公司取得勞務增值稅發票，但通過這種方式取得的可抵扣進項稅額，只是企業與勞務公司勞務支出差額納稅的部分。所以在現行稅制下，沒有辦法從企業的人工成本中全額抵扣增值稅，不利於這些制造業的增長。
因此，我們建議中央政府加快研究、制定和出臺允許勞動力成本稅前扣除的政策。這是當前增值稅改革亟待解決的問題，也是提升中國企業核心競爭力，幫助中國實體經濟盡快走出低迷的重要應對策略之壹。
同時，為了使國家財政平穩過渡，防止短時間內急劇下降造成的沖擊，建議改革可以分階段、分步驟進行:
1.全國不應該壹刀切。各省可以根據自己的實際情況制定自己的人工費扣除標準。對於欠發達省份，可以參照當地最低工資標準進行扣除，可以減緩突然減稅的波動，作為過渡；對於經濟水平較為發達的省份，建議可以按照當地平均工資水平進行扣除；
2.對企業科研人員，其勞務成本允許按實際成本全額扣除，允許扣除50%(與企業所得稅政策壹致)，以鼓勵企業加大科技創新投入，進壹步支持和發展創新型科技產業。目前，世界制造業中心正在從中國向東南亞轉移，這極大地影響了中國的實體經濟。為了解決這種情況，加大產品研發投入，增強企業創新能力，變“中國制造”為“中國制造”，從稅收政策上予以鼓勵，這將間接促進我國實體經濟早日升級。