(1)辦公室
負責文電、會議、機要等機關的日常政務運行；承擔文稿起草、財經調查研究、信息、新聞、檔案、安全、信訪等工作。牽頭內部制度建設、政務公開和信息化建設；負責對本局有關事項的監督；負責機關的行政管理和後勤保障；承擔局機關財務和國有資產管理工作，檢查和指導局機關所屬事業單位財務和國有資產管理工作。
(2)預算辦公室
分析研究金融經濟形勢，制定金融支持經濟社會發展的政策措施；研究提出財政政策、財務制度、預算管理制度和中長期財政發展規劃的建議；編制年度市級預算草案，辦理追加預算事宜；編制和匯總年度全市預算；承辦市級部門預算的審查、批準和調整；承擔市級部門支出標準體系建設和項目庫管理；提出開源節流、平衡財政收支的政策措施和建議；負責全市財政收入的組織協調和預算收支執行情況的分析。負責財務系統結算和轉移支付。負責罰沒收支預算管理，管理政府資金投入，牽頭政府債務管理。協助制定開發區的金融制度和金融支持開發區發展的政策措施；做好開發區的財務運行分析；協助相關企業轉讓後的財稅政策調整。
(3)財務部
執行國庫管理制度和政府總預算會計制度；承辦市級財政資金的調度；跟蹤、分析、檢查預算執行情況，研究制定預算執行相關管理和考核辦法，牽頭組織實施市級預算執行管理；編制市級財政決算和全市財政決算，編制全市行政事業單位決算；研究完善國庫集中支付制度；統壹管理市級財政資金賬戶，指導市級財政資金賬戶管理；承擔國庫現金管理相關工作；負責綜合財務統計。
(4)政府采購管理辦公室
擬訂政府采購的法律、法規和政策；管理和監督政府采購活動；研究調整市政府集中采購目錄和公開招標範圍的定額標準；承擔市級年度政府采購預算的編制和管理工作；根據上級要求，協助政府采購代理機構的資質認定和管理工作；處理市政府采購中的投訴；指導和分析全市政府采購工作。
(5)綜合辦公室(非稅收入征管辦公室)
研究制定全市非稅收入政策並組織實施，承擔市級非稅收入的征收管理；審核並上報市及市級部門的相關政府性基金和行政事業性收費；管理財務票據；承擔彩票管理和罰沒收入收繳管理的相關工作；牽頭有關部門制定國有土地、礦產等國有資源的稅收政策，協助有關部門研究國有土地、礦產等國有資源的使用政策和體制改革；協助相關部門做好保障性住房的政策研究和資金管理。
(6)稅務管理部(法規部)
承擔稅收部門預算相關工作；協助有關部門起草地方稅收法規；研究提出稅收政策調整方案；承擔稅收政策的協調、銜接和審核工作；監督稅收法律和政策的實施；進行稅務調查和分析；管理與減免稅、退稅、退稅有關的工作；承擔海關和稅務管理方面的工作。擬訂地方財稅立法計劃；組織起草、審查和上報財政稅收地方性法規；承擔規範性文件的合法性審查和管理工作；承擔國家賠償費用的管理工作；組織實施財政行政執法責任制；組織、監督、協調行政處罰、行政復議、行政訴訟、行政許可和行政審批；承擔金融法制宣傳教育工作。
(7)經濟建設司
研究制定有關財政投資的政策法規；負責基建財務管理，制定財務管理制度，編制基建預算；負責城市規劃建設、城市管理和交通資金的財務管理；負責環境保護資金的管理；擬定全市基本建設、城市建設、城市管理等支出定額和標準；負責財政投資項目概算、預算、決算的管理，制定項目概算、預算、決算的審核辦法；承擔相關政策性補貼資金和糧油等市級專項儲備資金的財務管理。
(8)企業辦公室
承擔安全生產等方面的部門預算相關工作；研究提出支持全市企業改革創新發展和市財政支持相關產業的財政政策，承擔相關資金管理工作；協助研究產業政策和企業改革政策；研究提出促進國內外貿易發展的金融政策，承擔相關資金管理工作；研究制定公用企業運營相關政策，承擔相關政策補貼資金管理；執行國家和國有企業之間的分配政策，組織制定國有資本經營預算制度，編制國有資本經營預算草案，匯總編制國有資本經營決算，收繳市屬企業國有資本收益；組織實施企業財務制度；協助制定企業國有資產管理的相關制度。
(9)對外經濟關系和財務部
指導和監督本市外商投資企業、旅遊企業、對外經濟企業和境外企業的財務管理；貫徹執行國家外債管理的政策法規，承擔全市利用國外貸款的有關工作；研究提出支持銀行、證券、新型農村金融組織等各類金融機構發展的金融政策，負責相關資金管理；指導地方各類金融機構的財務管理和資產監管工作。
(10)行政法律部
承擔行政、政法部門預算工作，研究提出相關財政政策；制定行政經費財務管理制度；貫徹國家政法經費保障政策體系，研究制定地方配套政策並組織實施；管理財政預算內黨政機關、事業單位和社會團體的出國(境)經費和非貿易外匯；承擔行政、政法部門著裝管理相關工作。
(xi)教科文組織辦事處
承擔教育、科技、文化等部門預算相關工作。研究提出支持教育、科學、文化改革和發展的財政政策，提出優化相關事業支出結構的建議；制定公用經費財務管理制度；監督教育、科技、文化等行業財務制度的執行情況；承擔市屬國有文化企業財務管理的相關工作；承擔義務教育經費保障機制改革的具體工作。
(十二)社會保障部
承擔人力資源和社會保障、民政、衛生等部門預算相關工作，研究提出相關財政政策；管理全市財政和社會保障、就業和醫療衛生支出，制定相關基金(資金)財務管理制度；承擔社會保障基金(資金)的財務監管；編制和審查市級社會保障預決算草案，審查和匯總全市社會保險基金預決算草案。
(十三)農業部
承擔農業、林業、水利、氣象部門預算工作，研究提出相關財政政策；制定財政支農資金管理辦法，承擔農業、林業、水利基本建設和農村合作組織、金融扶貧、農業救災防災等財政支農專項資金管理。
(14)農村金融管理辦公室
指導全市鄉鎮財政工作；研究提出本村相關財務政策，承擔相關項目資金管理；管理和監督村級組織運行經費；協助開展農業補貼政策研究，指導基層實施；配合有關部門監督中央和省級財政專項轉移支付資金使用情況，指導鄉鎮金融機構監督強農惠農資金使用情況。承擔糧食直補等政策性補貼資金的財務管理。
(15)農業發展基金管理辦公室
貫徹執行國家和省農業綜合開發的有關政策和資金、財務管理制度；協助編制農業綜合開發規劃和年度計劃；管理和統籌安排市財政和農業綜合開發資金；負責籌集防洪保安資金和籌集、使用、管理農業發展資金；負責中央、省、市農業綜合開發項目資金和財務管理。
(16)績效管理辦公室
擬訂財政資金績效管理的政策、制度和實施辦法；研究建立科學合理的財政資金績效管理機制和預算績效評價體系；擬定財政支出績效評價指標體系和標準體系；承擔財政專項資金的預算績效目標管理；組織實施市級財政支出績效評價；組織和指導市級部門(單位)開展財政資金績效管理；指導各縣開展財政資金績效管理。
(十七)行政事業資產管理處。
研究制定行政事業單位國有資產管理的政策和規章制度；制定行政事業單位國有資產管理辦法和清查登記辦法，組織指導市級行政事業單位國有資產監督管理工作；研究制定行政事業單位國有資產配置、調配、使用、處置和收益管理的政策和制度；制定市級行政事業單位資產配置、更新和報廢標準；建立和完善資產管理信息系統；承擔市屬文化企業國有資產管理工作；協助制定市級機構改革政策，並承擔相關實施工作。
(十八)會計事務所
依法管理全市會計工作；執行國家統壹的會計準則和法規；承擔全市會計從業資格和會計專業技術資格的管理工作；指導和監督會計人員的繼續教育。負責會計代理記賬業務的資格管理。指導和推廣會計信息化標準的實施。
(十九)監督檢查局
牽頭組織協調金融監管工作；制定金融監管政策和制度；監督財政稅收法律、法規和規章的執行；檢查和反映財務收支管理中的重大問題，提出加強財務管理的政策建議；承擔會計信息質量的監督檢查，接受上級財政部門的委托，檢查註冊會計師的業務素質；承擔機關及所屬事業單位的內部監督和審計工作；依法查處違反財經紀律的行為。
(20)人事教育司
承擔機關及下屬單位的機構設置和人事管理工作；負責機關離退休幹部工作，指導直屬單位離退休幹部工作。調查研究全市金融系統幹部隊伍建設情況，指導系統精神文明建設和思想政治工作；組織實施金融系統表彰活動；組織全市會計系列高級會計師職稱評審工作；制定並組織實施全市金融系統幹部教育培訓規劃，指導縣區金融教育工作；指導會計教育中心的工作。
政府機關黨委負責政府機關和直屬單位的黨群工作。
此外，按照有關規定設置紀檢監察機構。