沒區別。性質不同。免稅店是經過海關總署批準經營的店鋪，專櫃則是個體經營戶在合法合規的情況下向工商部門申請經營的商店。面向對象不同。免稅店向特定對象銷售，專櫃則是面向所有的消費者。商品種類不同。專櫃版套盒內容豐富些，搭配靈活些。免稅店則是搭配較少，但是免稅店版本會比專櫃實惠。
註意事項：
符合海關對免稅物品驗放的規定，即旅客有準予帶進免稅物品的額度，並在限定物品品種、數量範圍內。符合上述條件的旅客可到指定的免稅商店購買免稅商品。填寫購物單在外匯免稅商店營業窗口付款後，到海關窗口辦理審核手續。經海關審核批準，即在購物單提貨聯加蓋驗訖章。
旅客憑此單到提貨點提貨。付款和交海關審核時，均須出示符合規定的有效單證。旅客在境內免稅外匯商品經營單位購買的《限量表》第壹類物品，免稅總值限完稅價格人民幣2000元，單壹品種限自用合理數量。