民國14年(1925)，五卅慘案激起了全國人民的反帝憤怒。他離開學校參加廈門學生軍的訓練。當時廣州黃埔軍校在全國招生。他報名參加了考試，並被學生隊錄取。1926年，17歲的林夢飛離開黃埔軍校，以第四屆研究生身份，加入國民革命軍第24師葉挺部第72團，任連隊指導員。壹年後，南昌起義。林夢飛率領的百人小分隊全部陣亡，他本人也受了重傷。7月，24師赴江西，在湖岡宣布起義。他仍受著傷，與部隊失去了聯系。出院後回到廈門，與同安中央黨組織取得聯系，被派往馬巷洪厝村組織農民協會，開展農民運動。不久，因為同安的秘密機關被包圍，同誌被捕了。他離開同安，乘船到汕頭暫避。
民國戰爭
18年5月至21年9月，林夢飛在49師張震部任副大隊長、少校營長。十九路軍進入福建後，張震被撤職，他也離開了軍隊，在任保安調到上尉中隊長。後來去江西廬山教官培訓班學習了半年，24年底回到福建。從25年5月到31年2月，他在福建省軍政界的地位變化頻繁。歷任永春縣社訓總隊少校教官、武平縣縣長、永泰縣縣長、南安縣抗日自衛團團長、德化縣剿滅張雄南土匪指揮部團長參謀、莆田縣縣長、福建保安二團團長、泉州興泉區指揮部團長副指揮等職。
反抗起義
抗戰勝利後，曾卸下軍裝下海經商，任泉州車船運輸線經理。35-38年，先後任南京國民政府“全國代表大會”代表、福建省警備司令部少將訓練處處長、福建第四行政區專員兼少將警備司令、廈門少將警備司令部參謀長，在泉州創辦李群報並兼任廈門時報晚報董事長。
37年底加入廈門三民主義同誌聯合會(國民黨革命委員會前身之壹)，接受中南局領導；並策動325師副師長陳炎廉起義，多次解救黨員、進步人士數十人。廈門解放前兩個月，他轉戰閩中遊擊隊泉州支隊所在地南安嶺兜，後隨中國人民解放軍第十兵團派往廈門，成為廈門著名的起義將領。
新中國成立後
中華人民共和國成立後，港口被敵人封鎖，和國民黨起義者張組織了裕康輪船公司，任經理。利用在香港的舊關系，開展香港與廈門之間的貨物運輸，以緩解對軍用物資和民生物資的迫切需求。1951年，廈門飛達相紙工業有限公司成立，生產相紙供應國內市場，為國家節約了大量外匯。1956公私合營後更名為廈門感光化工廠，1959改為國營工廠，任廠長、顧問。
“文革”期間，他受到了嚴重的沖擊。
* * *十壹屆三中全會後，落實政策，恢復名譽，安排崗位。此後，他壹直關心國家大事，積極參與國家大事的討論。1981被聘為廈門經濟特區顧問，廈門經濟特區開發公司副董事長、副總經理，開展對外宣傳聯誼活動，引進華僑、臺灣、外資。1985年，中國國民黨革命委員會中央授予他“服務四化先進個人”稱號。
1994八月15去世。生前是福建省政協第七屆委員會副主席，民革福建省委員會名譽主席，中央委員，中央監察委員會常委，福建省黃埔軍校同學會會長。