盧良恕認為，加入世貿組織後，中國農業將享受大多數國家無條件的最惠國待遇，享受發展中國家的優惠待遇，減少歧視性待遇，利用相關機制解決貿易爭端，從而優化中國農產品出口的外部環境，為中國利用國際農業市場和資源創造良好的國際環境。在充分表達意見的情況下，中國可以自主參與新規則的制定，有利於在多邊體制下爭取和維護自身利益。加入世貿組織也有利於進口糧棉油等比較利益較低的資源密集型農產品，騰出資源發展水果、蔬菜、水產品、畜產品等外向型勞動密集型農產品。
同時，他相信加入世貿組織後，外資將更順利地進入中國，帶來先進的農業技術和管理經驗，提高中國農業的管理水平和生產水平。與國際農業教育、科研和技術的交流與合作將更加密切和頻繁，從而加速提高農業科技水平和農業增長的科技含量。此外，中國農業和農村經濟體制將進壹步深化改革，按照市場經濟的基本規律建立和完善國內農業宏觀調控體系。對加快農產品外貿體制和國內流通體制改革也將起到積極作用。
因為中國需要在遵守WTO相關規則的基礎上，承諾降低農產品貿易保護程度，逐步開放國內農產品市場，這意味著參與世界農產品貿易自由化進程將給中國農業發展帶來風險和挑戰。對此，盧良恕分析，國內農產品市場面臨對外開放的壓力是不可避免的，缺乏比較優勢的農產品將面臨沖擊。耕地集約、比較效益低的耕地農產品受到的沖擊會更明顯，如小麥、大豆、玉米、棉花、油料、糖和糖料等。對於東北、華北等大豆、玉米主產區來說，進口的增加會直接對這些地區的生產造成壓力，壹些需要飼料糧的南方省份也可能直接從國際市場進口玉米、大豆。此外，他還認為，目前較低的政策支持水平與我國農業規模不相稱，不利於我國通過農產品價格政策、生產資料補貼政策和收入政策調節農業生產成本和市場，調動農民生產積極性。
盧良恕最後說，實現中國農業和農村經濟結構的戰略性調整，必須緊緊依靠農業科技進步，用現代科學技術改造傳統農業，用現代科學方法管理農業，用現代科學文化知識武裝農民，提高農產品的科技含量、附加值和質量。