新辦企業要辦理自營進出口業務，需要在下列有關部門備案並辦理相關的手續：
1）商務廳/局 -- 憑營業執照及其他要求的材料和表格到地方商務廳/局的備案並獲得《對外貿易經營者備案登記表》，這樣才有資格進行進出口業務。
2）商檢局-- 辦理《自理報檢單位備案登記證明書》獲得商檢備案登記號，這樣才有資格進行法定商檢產品的報檢手續。對於法定檢驗的商品，如果沒有商檢放行憑條，海關不允許報關出口。3）海關 -- 辦理《中國海關進出口貨物收發貨人報關註冊登記證書》獲得單位的海關編號，這樣才能辦理海關出口報關的手續。購買出口報關單、報關委托書（也可請貨代幫忙代購）
4）外管局 -- 辦理外匯核銷、核銷單申領手續，安裝有關外匯核銷、核銷單網上備案的軟件，申領核銷單（8月份開始不需紙質核銷單，只需網上辦理手續），報關前，核銷單需要在網上先行備案。
5）銀行 -- 開立外匯帳戶，接受客戶貨款用。
正式辦理出口以前，必須先逐個在上述幾個部門辦理完成相關的手續以後才能夠辦理商檢、出口報關、收匯、核銷。
6）最後還要去國稅局-- 辦理退稅手續，公司需有專門的辦稅員來辦理退稅。
經過在上述各部門辦理完相關的登記或備案手續以後方可正式開始做出口業務。具體操作壹筆出口業務時，針對商檢、配船報關、收匯、核銷、退稅等各個出口流程，還有許多細節要求。等妳們辦理好上述手續後再逐壹告訴妳如何處理。