國家外匯管理局為副部級國家局，內設綜合司、國際收支司、經常項目管理司、資本項目管理司、管理檢查司、儲備管理司、人事司（內審司）7個職能司和機關黨委。設置中央外匯業務中心、信息中心、機關服務中心、《中國外匯》雜誌社4個事業單位。
國家外匯管理局在各省、自治區、直轄市、副省級城市設有34個分局、2個外匯管理部。即在省、自治區、
國家外匯管理局深圳分局
直轄市設立分局；在北京、重慶設立外匯管理部；在深圳市、大連市、青島市、廈門市、寧波市設立分局。國家外匯管理局還在有壹定外匯業務量、符合條件的部分地區（市）、縣（市）分別設立了國家外匯管理局中心支局、支局。國家外匯管理局的分支機構與當地的中國人民銀行分支機構合署辦公。
分支機構
國家外匯管理局在各省、自治區、直轄市、部分副省級城市設立分局（外匯管理部），在部分地（市）設立中心支局，在部分縣（市）設立支局。國家外匯管理局分支機構與當地中國人民銀行分支機構合署辦公。