1、加大了通貨膨脹的壓力，影響貨幣當局獨立制定貨幣政策。近年來外匯占款形式的基礎貨幣投放已經成為中央銀行貨幣投放的主要渠道。由於外匯儲備逐年增加，央行為了維持外匯市場的穩定，必須在外匯市場上買入外匯拋出本幣。通過貨幣乘數效應的作用，貨幣供應量被放大，不僅影響了貨幣政策的獨立性，而且造成了通貨膨脹的壓力。央行進行對沖操作的工具還比較有限，對沖效果也不明顯，因此如果外匯儲備持續以較快的速度增長，那麽通貨膨脹的壓力就會繼續增加。
2、導致經濟增長的動力結構不均衡，不利於實現經濟增長向內需主導型模式的轉變。我國高額外匯儲備的形成，是政府鼓勵出口、鼓勵招商引資等政策因素和人民幣升值預期因素在起主要作用。繼續維持這種主要依靠出口和投資拉動的經濟增長的動力結構，不僅有礙於落實科學發展觀、建立資源節約型和環境良好型社會的目標的實現，而且會損害經濟增長的潛力和後勁，不利於經濟的健康和可持續發展。
3、增大了人民幣升值壓力，不利於對外貿易順利開展巨額外匯儲備加大了人民幣匯率升值壓力，且使我國在相當程度上陷入減輕人民幣升值壓力與抑制貨幣供給增長難以兼顧的兩難境地：要減輕外匯占款造成的過多基礎貨幣發行對國內貨幣市場的影響，人民銀行必須加大回籠現金力度或提高利率，但這些操作將加大人民幣升值壓力;如果為了減輕人民幣升值壓力而增加貨幣供給或降低利率，本來就已經極為寬松的貨幣市場將因此變得過度寬松，從而刺激國內資產市場泡沫膨脹。我國有可能陷入“外匯儲備增長較快—人民幣升值預期—資金流入—外匯儲備繼續增長—進壹步的升值和資金流入”這種惡性循環。此外，不斷高漲的外匯儲備還會進壹步加劇貿易摩擦，惡化國際收支失衡，不利於我國外貿和經濟的可持續發展。
4、帶來高額的機會成本，加大資金收益風險，加大了匯率風險壹個國家持有外匯儲備，就是把這些資源儲存起來，而放棄和犧牲利用他們投資的機會，在經濟上就形成了壹種損失，這種損失也就是機會成本，壹國外匯儲備越多，機會成本也就越高。美元作為我國外匯儲備的主要資產，匯率波動較為頻繁，高額外匯儲備有可能承擔美元貶值的風險。
5、成為導致流動性過剩的重要原因，影響了銀行的資金使用效率，加劇了經濟結構失衡。巨額貿易順差通過結匯轉換成人民幣資金進入商業銀行，外匯占款作為基礎貨幣大規模投放在貨幣乘數作用機制下引起貨幣供應量的多倍擴張，使市場流動性急劇膨脹。商業銀行的存差規模日益擴大，貨幣市場流動性泛濫等問題，都與這壹因素有關。或許更嚴重的問題還在於，流動性過剩還會引發企業利潤下滑、投資過熱和通貨膨脹等壹系列消極後果。
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