分析師戴向暉說，“所謂市場風險是指，投資者在將股票作為擔保品進行融資時，不僅需要承擔原有的股票變化帶來的風險，還得承擔新投資股票帶來的風險，並支付相應的利息。”
另外，融資融券交易的復雜程度較高，更可能判斷失誤或操作不當，投資者的虧損可能比在現金交易方式下更為嚴重。對融資者而言，如果股價深跌，投資者所投入的資金便可能會全部化為烏有。
面臨保證金追加風險是說，投資者在交易過程中需要全程監控擔保比率水平，以保證其不低於所要求的維持保證金比例。融資融券所具有的逐日盯市和保證金可能持續支付的特點，就使得投資者融資買進的股票在下跌行情中出現類似期貨交易的“逼倉”
現象。因此，融資融券交易將使得投資者的行為更加短期化，對投資者的流動性管理要求也更高。
戴向暉介紹，融資融券針對的是個股，而個股時常會發生漲跌停或停牌，此種情形下，融資購券或賣券還款、融券賣出或買券還券可能都會因此受阻，產生較大的流動性風險。
按功能來分，融資融券下的投資策略有套期保值策略、投機策略和套利策略三大類。
1.融資融券下的套期保值策略
對沖個股的風險：對沖個股風險操作是基礎和相對簡單的。假設投資者持有某只股票，先要看它是否是可以賣空的標的證券。可以預料，滬深兩市允許賣空的標的股票只占全部上市股票總量的壹部分。在該股票屬於標的證券的條件下，為了對沖該只股票下跌的風險，投資者只要融券賣出相同數量的股票即可。如果該股票不屬於標的股票，投資者可以融券賣出與該股票相關系數較高的標的股票。
2.融資融券下的趨勢投機策略
對於趨勢投機策略，賣空的操作手法，壹般主要有兩種形式：如果投資者認為近期有利空，賣空者選取的策略往往是倒手砸盤，然後再低位買回，若選用這種操作手法，賣空量的大幅走高將導致未來股價的大幅下跌。
由於賣空機制要求報升規則，即賣空報價不能低於即時成交價，再加上直接砸盤有壹定難度，壹般投資者通常的做法是拉高出貨，然後再利用拉高買入的證券對市場進行沖擊，進而進行底部吸籌。若選用該類操作手法，賣空量的增加未必會導致股價立馬出現下跌，未來股價的走勢可能是先上升後下降的態勢。