第壹步、進入國家外匯管理局網上服務平臺（www.safesvc.gov.cn），打開“常用下載”中發布日期為2009-03-16的“國家外匯管理局直接投資外匯管理信息系統—用戶軟件（企業端）下載”，分別點擊“企業客戶端”、“企業客戶端下載”，下載安裝企業年檢客戶端，下載後解壓縮並安裝到本單位電腦中，下載時請註意旁邊的說明。各企業可以在國家外匯管理局網上服務平臺（www.safesvc.gov.cn）首頁的“常用下載”欄目中打開發布日期為2009-03-12的“國家外匯管理局直接投資外匯管理信息系統—用戶手冊（企業端）下載”裏下載年檢軟件的操作手冊以便參考。
打開安裝後的年檢客戶端軟件，輸入本單位9位企業組織機構代碼，用戶代碼為admin,用戶密碼為外匯登記證IC卡號後六位。點擊“登錄”。登錄後請務必首先在屏幕右上方“修改密碼”處修改密碼，並註意妥善保管新密碼。
點擊屏幕左上方“企業用戶管理”、“添加用戶”，在“添加用戶信息”界面中分別輸入新用戶代碼、用戶名稱，用戶狀態選擇“正常”，然後點擊“提交”。點屏幕右上方“退出”以退出年檢客戶端軟件。
重新打開年檢客戶端軟件，分別輸入本單位組織機構代碼以及剛才新添加的新用戶代碼進入，用戶密碼為000000（6個數字0），進入後同樣首先在屏幕右上方“修改密碼”處修改密碼並註意妥善保管好新密碼。
進入後在屏幕左上方分別打開“業務查詢”、“企業外匯登記最新狀況查詢”，手工將本單位基本信息抄寫下來或選擇“打印”以打印出本單位基本信息供下壹步備用，然後退出年檢客戶端軟件。
第二步、到國家外匯管理局網上服務平臺（www.safesvc.gov.cn）首頁的“公告欄”中打開“《2009年外商投資企業聯合年檢（外匯部分）信息登記表》的電子表格及填表說明下載”，將下載後的文件解壓縮後會得到“外商投資企業參加外匯年檢填報表格2009.xls”和“外商投資企業參加外匯年檢填報表格與說明”兩個文件，請先仔細閱讀“外商投資企業參加外匯年檢填報表格與說明”，然後打開“外商投資企業參加外匯年檢填報表格2009.xls”逐行填寫數據。請特別註意“外商投資企業參加外匯年檢填報表格2009.xls”中***包含“說明”、“外匯收支情況表”、“資產負債表主要數據”、“損益表”、“外方利潤處置情況表”5個部分，填寫時請留意每張表下都有填表說明，必須嚴格按照說明要求填寫。如果在2008年度內本企業有外方利潤處置行為的，必須註意“外方利潤處置情況表”中的“投資者代碼”必須嚴格按照上面第壹步打印出的企業基本信息中“股東投資信息”裏的投資者代碼填寫。全部填報完畢保存後打印出紙質報表，在第壹頁“企業蓋章”處加蓋單位公章。
第三步、重新打開年檢客戶端軟件，輸入本企業組織機構代碼、剛才新添加的新用戶代碼和用戶密碼進入，在屏幕左上方分別打開“年檢管理”、“外商投資企業年檢信息報送”，***有兩種填報方法：方法壹是點擊“年檢信息EXCEL文件導入”，選擇電腦中保存剛才已完成的EXCEL文件的目錄，打開後即會看到紅色提示正在導入，當看到跳出提示“導入成功”即完成導入工作。然後繼續壹路點擊“下壹步”按鈕，核對各報表的數據是否準確無誤，直到最後“外方利潤處置情況表”核對無誤後點擊“提交”按鈕即完成全部上報工作；方法二：可以不選擇“文件導入”方式，直接點擊“下壹步”在線填寫各報表，全部在線填寫完畢後同樣點擊“提交”按鈕完成上報數據。兩種填報方式可任選壹種，推薦采用第壹種方法。
第四步、完成網上上報工作之後，必須由本單位財務人員（因為需要現場核對數據，嚴禁由非財務人員前來）帶好：①在第二步中打印出的加蓋單位公章的紙制年檢信息登記表原件、②會計師事務所出具的《外匯收支情況表審核報告》及《外匯收支情況表》原件、③經會計師事務所審核的本企業2008年度審計報告原件、④本單位IC卡外匯登記證原件等材料前來外匯管理局16樓1603房間（無錫市五愛路33號）辦理現場審核年檢手續。
特別說明：在完成上述步驟後各企業仍然需要登陸商務部聯合年檢網站（www.lhnj.gov.cn）進行年檢申報.