首先肯定是經濟損失，包括直接和間接的，當時大樓重建，人員賠償，股市暴跌，還有對旅遊行業、交通運輸行業所帶來的損失更是巨大的。其次是惡劣的社會影響，包括給遇難者家屬帶來的心理創傷，人們對恐怖襲擊的恐懼。
據有關資料估計，9·11”事件造成的直接與間接經濟損失，以及相應的各項費用，超過了40000億美元，相當於2001年中國GDP的3倍。並且此次事件對美國民眾造成的心理影響極為深遠，美國民眾對經濟及政治上的安全感均被嚴重削弱。還有參與地面營救、清潔的消防員、警察、環衛工人等，他們染上了癌癥及其他疾病，長期受病痛折磨。
如果考慮到美國經濟放緩，進而加劇全球經濟的蕭條，“9·11”事件的影響更是無法估量。例如影響了人們的投資和消費信心，使美元貶值、股市下跌、石油等戰略物資價格壹度上漲，從而導致美國和世界其他國家經濟增長減慢。
恐怖事件之後，美國開始很長時間的善後的工作，包括重建大樓，疏導家屬等等。美國同時建立了國家紀念館九壹壹國家紀念館占地3萬多平方米，位於世貿中心遺址上。而作為對這次襲擊的回應，美國發動了“反恐戰爭”，入侵阿富汗以消滅藏匿基地組織恐怖分子，從而掌握了大量的石油礦石資源，所以也有人說這是美國的陰謀。