由於關聯關系的存在，可能會影響相關企業的財務狀況和經營成果。關聯方之間的交易不壹定發生在非關聯方之間，即使發生，交易價格也可能不同。由於非關聯方之間的交易壹般按照公允市場價格進行，關聯方之間交易的定價更具靈活性，往往高於或低於公允市場價格，因為投資企業對被投資企業的財務和經營決策具有重大影響。美國學者對164家美國跨國公司的調查顯示，只有35%的公司在內部交易中采用正常交易價格(許婧，1997)。關聯交易的轉讓定價對交易各方的利益影響很大，因此是關聯交易中的核心問題。
從理論上講，轉讓定價有兩種方法:基於市場的和基於成本的，以及在此基礎上發展起來的協議價格和雙重價格。但由於關聯交易轉移定價是企業戰略的壹部分，是企業實現經營戰略的重要手段(註:關聯交易轉移定價的非稅動機主要有:支持新公司、轉移資產和利潤、管理收益、轉移資金、考核業績等。)，企業在進行關聯交易時，往往會根據戰略需要調整交易價格。因此，關聯交易的實際轉讓價格往往或多或少地偏離其理論價格。在某些情況下，轉讓定價甚至遠低於其理論價格。
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