中國人民銀行呼和浩特中心支行機關現有幹部職工530多人。內設辦公室、貨幣信貸管理處、金融穩定處、調查統計處、會計財務處、支付結算處、反洗錢處、科技處、貨幣金銀處、國庫處、內審處、人事處、金融研究處、征信管理處、外匯綜合處、經常項目管理處、資本項目管理處、事後監督中心、保衛處和離退休幹部處，***20個職能處室；3個直屬單位，即營業部、後勤服務中心和鈔票處理中心；4個附屬單位，即清算中心、幹部培訓中心、基建辦和集中采購辦。黨群工作機構有黨委辦公室（與行政辦公室合署辦公）、組織部（與人事處合署辦公）、紀檢監察辦公室、工會辦公室；另設宣傳部、機關黨委辦公室、團委，3個機構合署辦公，統稱為宣傳群工部。
內蒙古自治區有11家地市中心支行，包括包頭市中心支行、呼倫貝爾市中心支行、興安盟中心支行、通遼市中心支行、赤峰市中心支行、錫林郭勒盟中心支行、烏蘭察布市中心支行、鄂爾多斯市中心支行、巴彥淖爾市中心支行、烏海市中心支行、阿拉善盟中心支行。
中國人民銀行呼和浩特中心支行下轄土默特左旗支行、托克托縣支行、和林格爾縣支行、清水河縣支行、武川縣支行，***5個旗縣支行。
（壹）職能處室：辦公室、貨幣信貸管理處、跨境人民幣業務辦公室、金融穩定處、調查統計處、會計財務處、支付結算處、反洗錢處、科技處、貨幣金銀處、國庫處、內審處、人事處、金融研究處、征信管理處、外匯綜合處（國際收支處）、經常項目管理處、資本項目管理處、事後監督中心、保衛處、離退休幹部處。
（二）黨群工作機構：黨委辦公室（與行政辦公室合署辦公）、組織部（與人事處合署辦公）、紀檢監察辦公室、工會辦公室，另設宣傳部、機關黨委辦公室、團委，三個機構合署辦公，統稱為宣傳群工部。
（三）直屬單位：營業部、清算中心、後勤服務中心、鈔票處理中心。
（四）業務領導機構：包頭市中心支行、呼倫貝爾市中心支行、興安盟中心支行、通遼市中心支行、赤峰市中心支行、錫林郭勒盟中心支行、烏蘭察布市中心支行、鄂爾多斯市中心支行、巴彥淖爾市中心支行、烏海市中心支行、阿拉善盟中心支行。
（五）下轄機構：土默特左旗支行、托克托縣支行、和林格爾縣支行、清水河縣支行、武川縣支行5個旗縣支行 。