通過建設現代支付體系，中國人民銀行將逐步形成以中國現代支付體系為核心，以商業銀行行內系統為基礎，地方和城市清算行並存，支持各種支付工具應用，滿足各種社會經濟活動支付需求的中國支付清算體系。
中國的現代支付系統有兩級處理中心，即全國處理中心(NPC)、省會城市和深圳城市處理中心(CCPC)。國家處理中心分別與各城市的處理中心相連，其通信網絡采用專網，以地面通信為主，衛星通信為輔。
政策性銀行和商業銀行是支付體系的重要參與者。各政策性銀行和商業銀行可通過省會城市分行使用行內系統與CCPC當地支付系統連接，或其總行與CCPC當地支付系統連接。同時，為解決中小金融機構結算匯款問題，允許農村信用社自建匯款系統，按照商業銀行與支付系統的連接方式辦理；城市商業銀行辦理銀行匯票業務，應根據支付系統的要求，開發自己的城市商業銀行匯票處理中心，依托支付系統辦理其銀行匯票資金在資金結算中的劃轉和支付。
中央銀行會計系統是現代支付系統運行的重要基礎。為了有效支持支付系統的建設和運行，並有助於加強會計管理，提高會計核算的質量和效率，中央銀行的會計核算將逐步集中。壹是縣支行會計集中到市中心支行，市中心支行會計集中系統與支付系統CCPC遠程連接。地市級以上國庫部門的國庫會計系統(TBS)可以直接接入CCPC，通過支付系統辦理國庫業務資金的匯劃。
為有效支持公開市場操作、債券發行和贖回以及債券交易的資金結算，公開市場操作系統、債券發行系統和中央債券簿記系統通過壹個接口與支付系統NPC進行物理連接，處理其交易的人民幣資金結算。為保證外匯交易資金的及時清算，外匯交易中心與支付系統上海CCPC聯網，處理人民幣外匯交易和資金結算，並下載全國同業拆借和歸還業務數據，用於央行對同業拆借業務的匹配管理。