第二，自主創業的風險。與普通投資者壹樣，在二級市場從事自營業務的證券公司也面臨著各種風險。由於對市場的誤判，買賣股票的時機選擇錯誤，證券組合不當。，可能會遭受損失。
第三，流動性風險。流動性風險是高負債水平金融機構面臨的普遍問題。
第四，內部管理風險。其表現形式是多方面的，如交易計算機系統故障、業務人員疏忽造成的交易失誤、業務人員內幕交易和違規操作造成的巨額損失、業務往來中的財務欺詐、重大項目投資或新業務決策失誤等。
第五，生存風險。目前我國小型證券公司的資產只有幾千萬元，而規模較大的證券公司，如證金、中泰、華南、華夏等全國性證券公司的註冊資本約為6543.8+0億元，與發達國家相差甚遠。