壹、紀檢委（監察室）
紀檢委書記：王文雷
指導系統內黨員的黨性、黨風和黨紀教育；受理系統內黨員及工作人員違反黨紀、政紀行為的檢舉、控告和申訴；對領導幹部、黨員和行政工作人員違法違紀行為進行立案調查處理；指導本系統黨風、行風建設和“雙評”工作；負責受理公路“三亂”的舉報和查處工作。
二、工會、團委（團委兼婦委會工作）
工會主席：周慧君
負責貫徹實施“公民道德建設實施綱要”組織開展社會主義勞動競賽和社會公益活動；維護職工的合法權益；貫徹落實《企業法》，參與企業的民主管理和民主監督；具體落實《工會法》，開展工會工作調研、參政議政；負責婦委會工作；負責***青團工作。
三、組織部
組織部部長：韓光林
負責指導黨的基層組織建設，指導基層班子和黨內民主生活會；負責黨員發展、教育、管理和培養非黨積極分子；負責基層班子和科級幹部定期考察以及後備幹部隊伍建設；負責幹部隊伍的教育培訓和幹部審查監督；負責老幹部管理工作；負責政工隊伍建設；負責組織工作調研。
四、宣傳部（兼統戰工作）
宣傳部部長：崔存山
負責黨的路線、方針、政策和交通方面的政策、法規的宣傳、學習、教育以及交通工作的宣傳報道；負責思想政治工作；負責本系統的社會主義精神文明建設；負責統戰工作。
五、黨委辦公室（兼信訪、武裝工作）
辦公室主任： 李福林
負責對黨和國家政策、法令及黨委決議貫徹情況的督辦、調研和信息反饋；負責黨委部門的綜合協調；負責黨委會議組織、文件管理、文書處理以及保密工作和黨委日常工作中的政務接待；負責信訪接待；負責武裝工作。
六、局辦公室（掛計生辦牌）
辦公室主任：陳 波
負責文電、信息、安全保衛、保密工作；負責機關財務、資產管理；負責機關日常工作的協調與督查；承辦政務公開工作；負責交通運輸網絡信息平臺管理與維護；負責計劃生育工作。
七、綜合規劃科（交通戰備科）
綜合規劃科科長：曲 鵬
組織編制全市交通運輸體系發展規劃；擬定相關行業發展戰略、規劃及有關計劃，參與擬定物流業發展戰略和規劃，提出有關政策和標準；提出市有關專項資金安排建議並監督實施；負責有關規劃和建設項目的前期立項審查及後期評價工作；負責組織編制港口規劃和岸線使用上報工作；承擔有關環境保護、利用外資、統計、調查、信息工作；組織擬定國防、邊防公路、水路中的中、長期發展規劃和年度計劃；承擔戰備公路、水路建設和維護組織實施工作；承擔公路、水路交通戰備物資的儲備、調撥等工作；承擔軍地溝通協調、國防動員等有關工作。
八、財務審計科
財務審計科科長：閔雅莉
貫徹落實交通運輸行業財務會計和審計工作規章制度；承擔財務管理、會計核算、引資、融資、專項資金管理、預決算、政府采購、外匯、信貸工作；承擔交通專項資金審計、局直屬單位行政負責人離任審計工作；指導交通運輸系統財務管理和國有資產保值增值；負責局直屬單位國有資產保值增值、財務支出、經濟效益以及局投資項目的審計工作；指導交通運輸行業經營工作。
九、科技教育科
科技教育科科長：金鴻兵
擬定公路、水路行業科技、教育、信息化相關政策、中長期發展規劃和年度計劃並監督實施；組織有關科技項目研究、推廣應用；承擔開展交通對外科技合作與交流；承擔有關標準、質量和計量工作；承擔涉及綜合運輸體系的標準協調工作；承擔交通行業信息化建設和信息資源開發利用管理工作；負責職工教育工作。
十、人事勞資科
人事勞資科科長：趙玉霞
負責機關、直屬單位的機構編制、人事管理和幹部管理工作；指導交通運輸行業人員隊伍建設
十壹、政策法規科
法規科科長：曹寶輝
組織起草相關規定，承擔有關規範性文件的合法性審核工作；指導交通運輸行政執法及法制宣傳教育工作；承辦相關行政復議和行政應訴工作；組織開展政策研究；指導交通行業體制改革；指導行業節能減排工作。
十二、建設管理科
建設管理科科長：馮昌龍
負責全市公路、水路工程建設相關政策、制度和技術標準的實施與監督；指導交通基礎設施建設和維護；承擔交通基礎設施建設市場管理責任；參與審查交通重點工程可行性研究報告；承擔交通重點工程施工圖設計、變更設計和規定權限內的初步設計審批；承擔交通重點工程、大中修工程建設監督管理、工程招標、施工許可、工程質量檢查、工程造價和規定限額內的竣工驗收工作；負責工程技術檔案管理。
十三、安全監督科
安全監督科科長：逄增波
貫徹落實黨和國家的安全生產方針、政策、法令及各項安全生產規章制度；擬定公路、水路突發事件應急預案並監督實施；指導有關安全生產和突發應急處置體系建設；承擔公路、水路運輸企業安全生產監督管理責任；組織協調省、市重點物資運輸和緊急客貨運輸；依法組織或參與有關事故調查、處理工作。