其實牛頓並不是晚年要去研究神學，牛頓對於神學的研究可是貫穿其壹生的。在牛頓的時代，西歐很多國家都是推崇基督教。英國的小孩子壹出生就要接受洗禮，從小被教育要相信上帝，這就好比我們從小接受的儒家教育壹樣。所以牛頓不相信上帝才怪呢。如果他不相信，也會受到社會主流的排擠。
但是，翻看他的筆記會發現牛頓是壹個矛盾體，他的確相信基督教，但是從來不對外透露自己的信仰。說牛頓晚年搞神學，這是對他的誤解。牛頓從五十歲開始就天天忙著造幣的事情，還忙著貨幣改革，退休下來之後年紀已經很大了，之後返回英國皇家協會開始養老。
牛頓的教派有壹個說法，每個年代都會有人代表上帝解釋壹切，而牛頓相信他就是那個被選中的人，因此他壹直試圖通過各種方法證明這些的存在。他壹生大部分時間都是研究宗教的年代學，來證明上帝的存在。
牛頓的墳墓雕像上有4本書，其中分別代表了他的4本著作，有壹本就是年代學。牛頓壹生也花了大量的精力研究煉金術，留下了600多萬字的筆記，做了大量的實驗，我們看牛頓的畫像大多是銀發，這是被汞給熏的。這也為推動化學發展起到了壹定作用，後代也有人稱牛頓為最偉大的煉金術士。
牛頓還試圖從數學，自然哲學的角度出發探求宇宙的規律，但恰恰是他最不用心的部分，使得他名聲大噪，而他終其壹生想要搞明白的神學，卻沒能忙出點什麽來。