加工貿易企業開展深加工結轉業務，應事先經外貿主管部門批準，並按規定辦理海關手續後，方可進行實際結轉貨物。
然後就是結轉的申請條件
1.轉出企業和轉入企業均已獲得海關簽發的《加工貿易登記手冊》；
2.轉出企業與轉入企業已簽訂加工貿易結轉合同或協議；
3.結轉合同或協議在《加工貿易登記手冊》的期限內。
如果貴公司能夠滿足上述申請條件，我將在下面回答您的問題。如有不妥，請見諒。
1)如妳所說，這涉及到稅收問題。如果做結轉的話，出口東西給他就不用交稅了，會降低他們的原材料成本。另壹個是相對於妳現在做的壹般貿易出口，通關成本節省，流程更簡單。
2)上面提到了第二個問題，即需要滿足以上三個條件。如果妳的材料是保稅的，基本沒有問題。
3)不知道貴公司是否符合以上三個條件。如果有，具體操作的主要流程如下。
1.計劃歸檔
(1)轉出企業在申請表(壹式四份)中填寫企業轉出計劃並簽字，憑申請表向轉出地海關備案；
(二)轉出地海關備案後，留存《申請表》第壹聯，其余三聯退還轉出企業；
(三)自向轉出企業所在地海關備案之日起20日內，憑申請表剩余三份填寫企業相關內容後，向轉出地海關辦理備案手續並簽字；
(4)轉入地海關審核後，留存申請表第二聯，第三聯、第四聯交轉入、轉出企業辦理轉入收發貨登記、報關手續。
2.收貨和交貨登記
(1)轉出、轉入企業辦理結轉計劃申報手續後，按照雙方海關批準的申請表實際收發貨。
(二)每批轉入轉出企業的出入庫記錄應如實登記在《保稅貨物實際結轉登記表》上，並加蓋企業結轉專用章。
(3)結轉退貨的，轉入、轉出企業應在登記表中登記實際退貨情況，同時註明“退貨”字樣，並加蓋企業結轉專用章。
3.結轉申報(先申報進口，再申報出口)
(1)轉出企業和轉入企業應分別在轉出地和轉入地辦理報關手續。轉出、轉入企業可憑壹張申請表批量或集中辦理報關手續。轉出(入)企業實際發送(接收)每批貨物後，應在90天內完成該批貨物的報關手續；
(二)轉入企業持申請表、登記表等單證在轉入地海關辦理進口申報手續，並在進口申報後的第二個工作日內通知轉出企業報關；
(三)轉出企業自接到轉入企業通知之日起10日內，憑申請表、登記表等單證辦理轉入出口報關手續；
(四)結轉進出口報關的申報價格為結轉貨物的實際成交價格；
(五)壹份結轉進口報關單對應壹份出口結轉出口報關單，兩份報關單之間對應的申報序號、商品編碼、數量、價格、手冊號應當壹致；
(6)結轉貨物分批申報的，企業應同時提供申請表和登記表原件及復印件。