1.出口貨物退稅企業應在其出口貨物裝載的運輸工具辦結海關手續後，向其報關的海關申請辦理出口貨物的退稅專用報關單（淺黃色）。出口貨物在口岸海關直接辦理出口手續的，由企業在口岸海關辦理。出口貨物在內地海關報關後轉關至口岸海關出口的，內地海關在收到口岸海關的轉關的通知單回執後，才予辦理出口貨物退稅專用報關單。海關根據實際出口貨物的數量、價格等簽發出口貨物專用報關單，並按規定收取簽證費。海關簽發出口貨物退稅專用報關單的時間為：裝載出口貨物的運輸工具辦結海關手續之日起，至海關放行貨物之日起的六個月內。
2.辦理出口退稅必須在出口貨物實際離境後，因此，存入出口監管倉庫的出口貨物要待貨物提取出倉庫並裝載運輸工具離境後，海關才能簽發出口貨物退稅裝用報關單。通過轉關運輸方式存入出口監管倉庫的貨物，企業應在貨物裝載運輸工具離境後，向處境地海關申請辦理出口貨物退稅專用報關單。
3.提取出口保稅倉庫貨物銷售給國內企業或三資企業進行深加工產品復出口的，海關按結轉加工的有關規定辦理，不予簽定出口貨物退稅專用報關單。
4.企業遺失海關簽發的出口貨物退稅專用報關單可以補辦，補辦時間為自該出口貨物辦結海關出口監管手續之日起6個月內。補辦時，企業應先到主管其出口退稅的地（市）國家稅務局申請，稅務機關經核實出口貨物確實未辦理過退稅後，簽發《關於申請出具（補辦報關單）證明的報告》。企業得到《報告》後，應該到出口貨物原簽發海關去辦理補辦報關手續。海關憑《報告》補簽出口貨物退稅專用報關單。
5.企業開展進料加工業務出口貨物辦理出口退稅，必須持外經貿主管部門批件，先送主管其出口退稅的稅務部門審核簽章，稅務部門逐筆登記並將復印件留存備查。海關憑有主管出口退稅稅務部門印章的外經貿主管部門的批件，方能辦理出口料件“登記手冊”。企業因故未能執行進料加工合同，需持原“登記手冊”或海關證明到主管稅務部門辦理註銷手續。
6.外商投資企業辦理出口貨物退稅，根據《中華人民***和國增值稅暫行條例》和國務院有關規定，對1994年1月1日以後辦理工商登記的外商投資企業生產出口貨物，符合《出口貨物退（免）稅管理辦法》的在辦結海關出口手續後，可申請辦理出口貨物退稅專用報關章。
7.出口貨物遇特殊情況發生退關或退運，如海關已簽發了出口貨物退稅專用報關單，報關人需將該報關單退交海關；如企業以交國家稅務局辦理了退稅手續，則應向稅務局申請《出口商品退運已補稅證明》，在辦理退關或退運報關時隨報關單等壹並遞交海關，才予辦理退關或退運。
8.對出口企業違法騙取退稅的行為，由海關和稅務機關按有關規定分別處理。
出口收匯核銷的流程:
（1）出口企業在發貨前到外匯管理部門領取出口收匯核銷單，攜帶電子口岸卡和電子口岸卡註冊人的身份證（並且只限本人領取），第壹次領取需要帶即將出口的合同去領取，後面就不用帶合同了。
（2）出口企業報關時，向海關提交事先從外匯管理部門領取的有順序編號的外匯核銷單，經海關審核無誤，在核銷單和與核銷單有相同編號的報關單上蓋“驗訖章”。 （這部分我司是交給貨運代理操作，具體我不太清楚，引用了LS的原話）
（3）貨物出口後，外方付的款匯到我國的銀行後會先進入壹個外管局要求的待核查賬戶，銀行會向出口單位出具結匯水單或收賬通知，出口企業的會計需要填寫相關的收匯文件和核銷文件，並提供款相對應的核銷單號碼送交銀行進行收結匯。（海運費用需要在單據上註明按照非貿易貨款進行結匯，以防扣除妳在銀行的貿易貨款額度）
（4）網上核銷用戶，企業直接登陸系統，根據貨物性質選擇逐筆核銷或者批次核銷即可（按貨幣種類選擇）。出口單位憑出口收匯核銷單（出口後由海關退回）和出口收匯核銷專用聯（銀行辦理核銷後提供），如出口收匯核銷單和出口收回核銷專用聯上金額的差額太大，可能會被要求親自寫說明帶齊文件到國家外匯管理部門辦理核銷手續。
（5）國家外匯管理部門按規定辦理核銷後，在核銷單上加蓋“已核銷”章，並將其中的出口退稅專用聯退還給出口單位作為日後退稅依據。 （這壹項2008年6月就已經取消，現在從海關退回的出口收匯核銷單再下壹步使用就是出口退稅程序了。）
p.s 從外管局領回出口收匯核銷單後，需要先上“電子口岸網”進行網上備案才可以交與海關使用，待使用後海關退回還要上“電子口岸網”進行網上交單才能進行後續核銷工作。出口收匯核銷單領取前要上“電子口岸網”提交申請數量，負責去外管局領不出來。還有出口收回核銷單要按需領取，每次領取的數量自己控制，但不能超過3個月使用期限，否則就不能領取新的核銷單，要等手裏的所有核銷單使用完畢才可以再領。
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再關於退稅的問題，建議參加電子口岸提供的退稅培訓課程，講解的可能會比較清楚，就是小貴，我記得的壹次課程可能是580。我頭幾年曾經負責過退稅，後來移交給會計做了，我就專攻業務方面了。
退稅問題很難在百度知道裏說清楚，單說是壹套程序而已，但是在處理中會有各種不同的問題出現，比如增值稅票認證晚了退稅時就會有非交叉稽核信息，去年又有了新的規定，限制出口90天內必須正式申報，總之這部分可是要多多費心，耽誤了這個時間，沒有退稅損失就大了。