國家外匯管理局為副部級國家局，內設綜合司、國際收支司、經常項目管理司、資本項目管理司、管理檢查司、儲備管理司、人事司（內審司）7個職能司和機關黨委。
設置中央外匯業務中心、信息中心、機關服務中心、《中國外匯》雜誌社4個事業單位。