事實上，孔雀大明王菩薩不僅僅有兩個孩子，他還有壹個孩子，也就是如來佛祖。而孔雀之所以會成為如來佛祖的母親，是因為孔雀大明王菩薩曾經吃下了如來佛祖，而孔雀大明王菩薩生育的兩個孩子則是靠著?交合之氣?生育的。
孔雀大明王菩薩原本是鳳凰的兒子，他生下來便有?氣吞山河?的本事，壹口下去能夠直接吃掉壹個城池的人，而如來佛祖也被孔雀大明王菩薩吃掉過，後來如來佛祖破開孔雀大明王菩薩的脊背才逃出來，隨後如來佛祖本來想殺了孔雀大明王菩薩，但是其他佛祖卻勸說道：?妳這樣做就等於是殺了自己的母親。?所以如來佛祖才將孔雀封為孔雀大明王菩薩，這也是如來佛祖會成為孔雀大明王菩薩的兒子的原因。
除了如來佛祖之外，孔雀大明王菩薩還有壹子壹女，分別是昴日星官和孔雀公主。當初孔雀大明王菩薩還只是壹只孔雀而已，遇到了還是母雞的毗藍婆菩薩，兩個人相愛並且生下了壹個兒子，也就是昴日星官，後來孔雀大明王菩薩和毗藍婆菩薩才成為的菩薩，而毗藍婆菩薩原本是道教中人，只是因為毗藍婆菩薩和孔雀大明王菩薩曾有過壹段感情，所以如來佛祖也給了毗藍婆菩薩壹個佛教的尊號。
而孔雀公主則是孔雀大明王菩薩自己生育的，說到這裏可能大家就要疑惑了？孔雀大明王菩薩明明是公的，那他要如何生育孩子呢？其實孔雀大明王菩薩生育孔雀公主和鳳凰生育孔雀大明王菩薩是壹個道理，鳳凰本身也是公的，但是他吸取了天地間的?交合之氣?，這才有了孔雀大明王菩薩，而孔雀大明王菩薩也是吸取了?交合之氣?才生下了孔雀公主這個女兒。