戰爭初期，巴拉圭由於戰爭準備不足且裝備陳舊，缺少武器，甚至有的士兵沒有槍支而使用彎刀作武器。巴軍因而明顯處於下風。
1932年8月初，巴拉圭進行全國總動員，總兵力從3000人迅速擴充到6萬人。由何塞·費利克斯·埃斯蒂加裏維亞（José Félix Estigarribia）中校指揮，於1932年8月12日收復皮蒂安圖塔，1932年9月底收復博克龍，1932年10月23日奪取了玻軍前線指揮部阿爾塞要塞，殲玻軍1200人。
1932年12月，玻軍改由德國將軍漢斯·孔特（HansKundt）指揮。1933年初，玻軍集中兵力進攻巴軍要塞納納瓦，久攻不克，雙方損失慘重。
1933年5月10日，巴拉圭正式對玻利維亞宣戰。埃斯蒂加裏維亞經數月準備，於1933年10月指揮2.5萬名巴軍在70公裏長的戰線上發起反攻，至12月中旬把戰爭推向玻利維亞占領的查科地區，殲玻軍2個師、俘獲8000人。玻軍遭此慘敗後，由佩尼亞蘭達將軍接替孔特負責指揮。
1934年1月，巴軍向皮科馬約河左岸玻軍要塞巴伊維安發起進攻。
1934年3～7月，雙方在此展開血戰。1934年11月17日，巴伊維安失陷。至年底，巴拉圭控制歸屬有爭議的北查科地區。
1935年1月中旬，巴軍進入玻境，推進到帕拉佩蒂河畔。1935年2月，玻軍從比亞蒙特斯發起反攻，將巴軍擊退。此時雙方都損失慘重，均無力再戰。