仁宗即位之後，想將在武宗回京即位前謀篡之臣全部法辦誅殺。楊朵兒只說：“為政而喜好殺人，不是壹個帝王應有的做法。”提醒了仁宗，後來仁宗下令，只將為首幾個殺掉了，天下人稱善。有壹次，仁宗與李孟評價天下人才，李孟認為楊朵兒只在才、德方面都是天下第壹。仁宗也持同樣的看法，後來，仁宗任命楊朵兒只為禮部尚書。
有壹次，壹個大臣向仁宗進言說，仁宗身邊的親信接受了他人的賄賂。仁宗認為這個大臣說了不應當說的話，很生氣，想殺掉他。時任禦史中丞的張珪叩頭而諫，仁宗都不聽，楊朵兒只向仁宗說：“只因為說了壹句話，就殺人，不合國家的法律；不聽諫臣的進言，不應該，當今世上沒有直言諫臣，已經很長時間了。張珪是個真正的中丞。”仁宗轉怒為喜，采納了張珪的話，任命楊朵兒只為侍禦史。即使在平時，楊朵兒只在仁宗面前也不茍言笑，壹臉正色。有犯國法的人，不管是誰，即便是皇帝身邊的貴幸，也決不有壹絲縱容，所以，說他壞話的人很多，但仁宗對楊朵兒只了解很深，所以讒言也沒有絲毫作用。後來仁宗任命他為資德大夫，禦史中丞。朝中的壹個官員與百姓爭地，楊朵兒只認為此人有失大體，將其彈劾並罷免其職。江東、西奉使斡來不稱職，朝中當權的大臣想隱瞞其種種不法行為，也不想讓人來處理他。楊朵兒只彈劾了斡來，斡來羞愧而死。
有壹次，禦史納磷言事忤怒仁宗，楊朵兒只壹天上了八九個奏折，想救下納磷，說：“不是因為我喜歡納磷這個人，而是因為我不想讓您擔當殺禦史的名聲。”仁宗說：“看在妳的面子上，我就不殺他了，讓他去昌平吧。”楊朵兒只說：“讓他去昌平，沒有什麽不可以的，但因為言事而降職，我擔心後來的人，會引以為戒，不再說話了。”仁宗不聽。過了幾天，仁宗讀《貞觀政要》，楊朵兒只正在跟前，仁宗感慨地說：“魏征，真是古代少有的好大臣，我怎麽能用上這樣的人呢？”楊朵兒只說：“那是因為唐太宗給了他機會，如太宗不給他機會，魏征想做直臣，他也不會有可能。”仁宗聽了之後，笑著說：“妳還是惦記納磷的事吧？我就赦免了他，以成就妳直諫的名聲。”就這樣，仁宗采納了楊朵兒只的建議。後來，朝廷給了他昭文館大學士，榮祿大夫的榮譽，作為對他直言的回報。
當時位居壹品大員的朝官，有許多向仁宗請求王爵，贈封先世。有人就對楊朵兒只說：“妳現在正受皇上重用，如果也向皇上提出類似請求，皇上肯定會答應的。”楊朵兒只說：“我出身寒微，幸虧遇見皇上看得起，提拔我在朝中任職，我內心就怕不能稱職，我哪裏還敢有其他的奢望呢？況且，如果我真的那樣做了，又怎麽能不讓別人也那樣做呢？”楊朵兒只不僅敢言直諫，主持正義，而且他時時處處以身作則，身行正義，所以，才受到朝廷內外的尊重。