神木隆之介配過的角色有坊寶寶、馬魯克、小磯健二、翔和立花瀧。
1、坊寶寶：2001年，天真可愛又富有表現力的聲音被宮崎駿發掘，神木隆之介首次為吉蔔力工作室動畫電影《千與千尋》中的坊寶寶擔任配音。
2、馬魯克：2004年，神木隆之介參與吉蔔力工作室動畫《哈爾的移動城堡》，為角色馬魯克配音。
3、小磯健二：2009年，神木隆之介為細田守導演的動畫電影《夏日大作戰》中的主角小磯健二配音，被導演稱為連頭發翹起的形狀都與漫畫主人公酷似的配音演員。
4、翔：2010年，神木隆之介為吉蔔力工作室動畫《借東西的小人阿莉埃蒂》中的男主翔配音。
5、立花瀧：2016年8月，神木隆之介為新海誠執導的動畫電影《妳的名字》男主角立花瀧配音。