《哥斯拉大戰金剛》沒有彩蛋，導演說電影之所以沒有彩蛋，是因為某些原因，所以他將原本拍好的彩蛋融入在了正片中，導演還說，哥斯拉系列的電影沒有必要非得像漫威宇宙壹樣每壹部片尾都放彩蛋。
這部電影主要講述了哥斯拉和金剛這兩頭怪獸之間的大戰，帝王組織在骷髏島建立了觀察區，大部分資料也向公眾公開，壹家高科技公司APEX利用這些資料正在嘗試壹項大膽的任務，他們想要徹底消滅哥斯拉，但這項任務十分危險，而且有很大可能會失敗。
哥斯拉雖然對人類沒有惡意，但它感受到自己的安全受到威脅後便開始向人類發動攻擊，APEX見狀便準備利用和哥斯拉戰鬥力差不多的金剛來對付哥斯拉，同時他們還準備用金剛來探尋地心世界以獲得更多能源。金剛只不過是想要回到自己的家園，但卻被有心之人利用，和哥斯拉對決並不是它的本意，只可惜兩者根本無法溝通。