在動畫《精靈寶可夢XY》中羈絆夠深的話，更能進化為獨壹無二的小智版甲賀忍蛙，是小智在卡洛斯地區收服到的王牌寶可夢。
當訓練家與寶可夢之間的羈絆和信賴關系而產生的，能激發寶可夢的潛力的“羈絆現象”，傳說僅在數百年前的卡洛斯地方的忍者村中出現過壹次。
甲賀忍蛙的形態為雙足大蛙的寶可夢，身體及雙腿為深藍色，胸部為黃色，四肢各有大白泡，腿上各有壹個四角星型標記，看起來像手裏劍，前肢有三指，後肢有兩指，腳上有蹼。面孔下部和尖尖耳朵為淺黃色，眼睛上方有白斑，眼睛裏有白鞏膜、紅虹膜和白瞳孔，圍著頸子的粉紅“圍巾”是舌頭。
擴展資料在決戰忍者村！呱頭蛙對劈斬司令!!中，呱頭蛙進化為甲賀忍蛙，並首次變身小智版甲賀忍蛙戰勝了兵太夫的劈斬司令。
在終結洞窟！Z的謎團傾巢而出!!中，甲賀忍蛙與閃焰隊的芭菈和克蕾兒對戰時，再次變為小智版甲賀忍蛙。
在最強超級進化對戰！甲賀忍蛙VS超級噴火龍!!中，小智與翔太對戰時，小智派出甲賀忍蛙與翔太的蜥蜴王對戰。對戰過程中，甲賀忍蛙變為小智版甲賀忍蛙，並使用燕返擊敗了翔太的蜥蜴王。
當艾嵐看到小智的甲賀忍蛙與翔太的對戰後，於第二天向小智和甲賀忍蛙提出了對戰邀請。甲賀忍蛙在與艾嵐的超級噴火龍X對戰時再次變為小智版甲賀忍蛙，但最終還是被超級噴火龍X的爆炸烈焰所打敗。
在小智與艾嵐！甲賀忍蛙再度VS超級噴火龍!!中，艾嵐再次遇到正在寶可夢中心的甲賀忍蛙，並發現小智壹行人，小智向艾嵐發出對戰邀請。
對戰過程中甲賀忍蛙變為小智版甲賀忍蛙，正當甲賀忍蛙占上風時，小智身體卻突然無法行動，並因為體力無法負荷而昏迷過去，當小智清醒時跟艾嵐說當他可以掌握時將再次對戰。在與超級噴火龍X的對戰中，希特隆通過自己的發明，驗證了發動條件是小智與甲賀忍蛙的心情同步。