1994年，10歲的托雷斯加入了Rayo13俱樂部——他的第壹支正規球隊（踢11人制的比賽）。在那的第壹個賽季，他進了55球， 獲得了到馬競試訓的機會。托雷斯是三位能夠到馬德裏競技試腳的其中壹位球員。 1995年，11歲的托雷斯加入了馬競的青訓學院，師從ManoloRangel。同年加入了馬德裏競技的少年隊，為球隊打入55個進球。1996年，12歲的托雷斯拒絕了皇家馬德裏的邀請。2000年托雷斯首次為馬德裏競技上陣，球衣號碼為9號。
2001年5月27日，17歲零68天的托雷斯在ElCalderon首次亮相，對手是萊加內斯，成為代表馬競出場的最年輕球員。壹周後，他在馬競的第二場比賽，對陣阿巴謝特隊，他不僅促成對方兩名球員被罰下場，還攻入了自己在馬競壹隊的處子球，在對陣雷加尼斯隊的比賽中迎來了第壹次首發出戰的機會。 但在與Getafe的比賽結束之後，馬競由於凈勝球之差而失去了升級甲級聯賽的機會。2000-01賽季托雷斯只出場4次，但已有1球收獲。
在西乙掙紮兩年之後，2002-03賽季，馬競重新殺回西甲，在這之前，托雷斯在西班牙足球乙級聯賽兩季***上陣40場，射入7球。 年輕的托雷斯在球隊升入西甲的2002-03賽季***有13個進球。
2003-04賽季，19歲的托雷斯在35次聯賽出場中打進19個聯賽進球， 還成為俱樂部最年輕的隊長。 該季馬德裏競技只得第七，排在塞維利亞之後，而直接原因就是馬競與塞維利亞的兩次對抗的成績分別為2：1勝壹場和0：2輸壹場，馬競也因此失去了參加歐洲聯盟杯的資格。只可參加國際托托杯，托雷斯也得以首次體驗歐洲賽場。然而，在決賽中馬競在點球大戰中不敵比利亞雷亞爾。托雷斯歐戰出場五次，打進兩球。
托雷斯為馬德裏競技留下的紀錄是：244場比賽打進91球 2007年7月4日22點，利物浦足球俱樂部召開新聞發布會，正式宣布以2200萬英鎊簽下費爾南多·托雷斯，雙方簽訂6年合約， 周薪達9萬鎊，是利物浦的破紀錄高價收購。托雷斯的轉會費為2650萬英鎊，其中2050萬為現金支付，而路易斯-加西亞作為600萬的籌碼轉投馬競， 打破了當年利物浦購買西塞的轉會費紀錄（1400萬英鎊）。托雷斯同時創造利物浦俱樂部最高轉會費紀錄和西班牙球員最高身價紀錄。
2007年7月21日托雷斯通過了利物浦的體檢，22日完成了簽約，22日上午在馬德裏的新聞發布會上和馬競球迷最後道別，下午又飛赴安菲爾德，作為利物浦球員和媒體見面。 在利物浦，托雷斯身穿9號球衣，在利物浦的歷史上，伊恩·拉什和羅比·福勒都曾身披這個號碼。
2007年7月19日，在瑞士進行的壹場季前熱身賽，利物浦3：2擊敗不萊梅，托雷斯首次代表利物浦登場，不過接連錯失了至少兩次的絕佳機會。 8月4日，荷蘭鹿特丹四強賽展開爭奪，托雷斯在第13分鐘打入在利物浦的處子球，最終利物浦2：0力克上海申花。
2007年8月11日英超第1輪，利物浦做客維拉公園2：1戰勝維拉，托雷斯英超首秀，出場79分鐘，19次觸球，3次有威脅傳球，3次射門。 8月19日，英超聯賽第3輪，利物浦在安菲爾德球場1：1戰平切爾西，托雷斯在第16分鐘接傑拉德直傳打進壹粒進球，這也是托雷斯的英超處子球。 8月25日英超第4輪，利物浦做客光明球場挑戰升班馬桑德蘭，托雷斯在第86分鐘助攻沃洛寧打進壹球，收獲英超首次助攻，最終利物浦利物浦2：0桑德蘭。 9月1日英超第5輪，利物浦在安菲爾德球場迎戰升班馬德比郡，托雷斯分別在第56分鐘和第76分鐘進球，個人英超首次梅開二度，最終利物浦6：0大勝德比郡。 9月26日，英格蘭聯賽杯第3輪，利物浦在麥德斯基體育場客場挑戰雷丁隊，托雷斯在第49分鐘、第72分鐘和第86分鐘連入三球，完成加盟利物浦後的首個帽子戲法，最終利物浦以4：2力克雷丁。
托雷斯在利物浦的第壹個賽季就為紅軍打入24球，成為自1995-96賽季的福勒後，首位能於壹季射入超過20個聯賽入球的利物浦球員。
2008年2月23日，英超第27輪比賽，利物浦在安菲爾德迎戰米德爾斯堡，托雷斯表現非常出色，分別在第28分鐘、第29分鐘和第61分鐘打入三球，完成英超首次帽子戲法，最終利物浦主場3：2力克米堡。 2008年3月6日，2007-08賽季英格蘭足球超級聯賽第2輪壹場補賽，利物浦4：0戰勝西漢姆聯隊。托雷斯再次上演帽子戲法，連續兩場比賽上演帽子戲法。
2009年歐冠1/8決賽，托雷斯在第二回合打進爭議球，利物浦最終兩回合總比分5：0戰勝皇家馬德裏。
2008-09賽季，托雷斯在各項賽事出場46次，貢獻33球。2010年，傷病讓托雷斯在利物浦的出場次數逐漸下降，到2009-10賽季，金童代表利物浦出戰21場，但仍然貢獻了18個進球。
托雷斯為利物浦留下的紀錄是：142場比賽打進81球。 2011年1月31日，托雷斯轉會切爾西， 身穿9號球衣，但他在第14場比賽中只打進1球，在雨中的斯坦福橋球場攻破西漢姆的球門。這也是他2010-11賽季為切爾西打進的唯壹進球，
托雷斯經歷壹個夏天的恢復休整後，在2011-12賽季，首輪對斯托克城雖未進球，但也表現優異。此後客場1：3不敵曼聯的比賽中，托雷斯打進壹球，在最後時段帶球越過德赫亞，卻錯過了將球送入空門的機會。隨後歐冠5：0大勝亨克壹戰中，托雷斯梅開二度，但在年末階段他陷入了進球荒。
2012年3月28日，托雷斯在歐冠8強對本菲卡的比賽中雖然沒有進球，但轉而為隊友創造機會，在客場對本菲卡時，邊路突破後防助攻卡盧打入關鍵壹球。 4月25日，歐冠半決賽次回合切爾西客場2：2逼平巴塞羅那，從而總比分3：2淘汰巴薩。托雷斯為切爾西打進扳平壹球。 4月29日，英超第36輪，在切爾西對女王公園巡遊者的比賽中，托雷斯完成了切爾西首個帽子戲法，幫助切爾西6：1戰勝巡遊者
2012年5月5日，2011-12賽季第131屆英格蘭足總杯決賽，切爾西在溫布利大球場對陣利物浦。托雷斯作為替補並未登場，但切爾西2：1擊敗了利物浦，歷史上第7次捧起足總杯，近6年來4奪該項賽事冠軍。
2012年5月20日，2011-12賽季歐冠聯賽決賽在慕尼黑安聯球場展開爭奪，托雷斯替補登場，在終場前兩分鐘爭得切爾西全場唯壹壹個角球，德羅巴利用這個角球頭球破門扳平比分。點球大戰後切爾西總比分5：4擊敗拜仁，歷史上首次獲得歐冠冠軍。
2012年8月12日，2012-13賽季英格蘭社區盾杯賽在伯明翰的維拉球場展開爭奪，切爾西2：3輸給曼城，托雷斯先拔頭籌，伊萬諾維奇隨後被紅牌罰下，曼城連入3球逆轉，失掉冠軍。 托雷斯在隨後聯賽對陣雷丁和紐卡斯爾的聯賽中連續破門。並在切爾西客場對陣阿森納那次2：1的勝利中為藍軍首開紀錄。
可隨後在切爾西主場2：3不敵曼聯的比賽中，托雷斯因壹次頗具爭議的判罰領到了藍軍生涯的第二張紅牌被罰下場。錄像回放清晰地顯示出他被埃文斯侵犯絆倒，但主裁判馬克-克拉滕伯格以假摔之名向他出示了第二張黃牌。此後托雷斯在聯賽中的狀態下滑，切爾西也在歐冠小組賽中被淘汰只能參加歐聯杯。
在歐聯杯上，托雷斯助切爾西壹路殺到決賽，每壹輪淘汰賽都有球。在決賽中還打入壹球獲得冠軍。在藍軍切爾西3：1戰勝布加勒斯特星的歐聯比賽中，托雷斯打進了關鍵的制勝球，幫助切爾西總比分3：2晉級。接著他又在1/4決賽首回合擊敗喀山紅寶石的比賽中梅開二度，並在次回合客場為切爾西首開紀錄。在半決賽第二回合為切爾西打入鎖定勝局壹球。在切爾西戰勝本菲卡的歐聯決賽中，他為藍軍打破僵局。
2013年5月19日，英超聯賽收官戰中，他在第76分鐘的絕殺球幫助球隊2：1擊敗埃弗頓，這也是托雷斯2012-2013賽季第22粒進球，成為隊內各項賽事的隊內最佳射手。
2014年8月30日，AC米蘭通過官方網站宣布從切爾西租借切爾西前鋒費爾南多-托雷斯，時間為兩個賽季，而托雷斯與切爾西的合同將在兩個賽季後到期。
托雷斯為切爾西***計出場172場打進46球 2014年8月29日，切爾西官方宣布托雷斯被租借至AC米蘭隊。
2014年9月21日，2014-15賽季意甲聯賽第3輪，AC米蘭0：1不敵尤文圖斯。托雷斯在第76分鐘替補出場換下了波利，迎來個人在AC米蘭的首秀。
2014年9月24日2時45分，2014-15賽季意甲第4輪，AC米蘭客場2：2平升班馬恩波利。托雷斯迎來在AC米蘭的首次先發，並打進個人在AC米蘭的處子球，第43分鐘，阿巴特右路斜傳，托雷斯前點距門11米處頭球吊射入遠角。此後還助攻梅內打中橫梁， 這也是其在意甲打進的唯壹進球。
2014年12月28日淩晨，切爾西在官方網站宣布托雷斯被AC米蘭買斷，同時，AC米蘭也在其官網對此消息進行了確認。 2014年12月29日下午，馬德裏競技官方宣布托雷斯加盟，他將以租借的形式為床單軍團效力至2016年，這也是昔日金童時隔7年重返卡爾德隆球場。
托雷斯正式亮相 人山人海!45000人見證金童回家
2015年1月4日對於托雷斯本人，馬競俱樂部以及馬競球迷來說，都是個特殊的日子，因為托雷斯這位馬競昔日的招牌人物，在外漂泊了七年半之後終於在不久之前確定回家，於1月4日正式亮相。昔日英雄的回歸儀式，當然是死忠們不可錯過的，據《馬卡報》報道，有大約45000名球迷來到卡爾德隆歡迎托雷斯的回歸。
2015年1月16日03:00(西班牙當地時間15日20:00)，2014/15賽季西班牙國王杯1/8次回合壹場焦點戰在伯納烏球場展開角逐，皇家馬德裏主場2比2戰平馬德裏競技，托雷斯梅開二度，拉莫斯和C-羅納爾多兩度扳平。馬競總比分4比2晉級八強。
馬競開場僅48秒取得領先，馬裏奧-蘇亞雷斯直傳，格裏茲曼擺脫佩佩後突入禁區左側傳中，無人防守的托雷斯10碼處掃射入網。這是他重返馬競後的首粒入球。
托雷斯時隔八年西甲入球助馬競取勝
2015年3月21日西甲第28輪，馬德裏競技在馬德裏大區德比中輕松取勝。托雷斯時隔八年終於又在西甲聯賽中進球，幫助“床單軍團”主場2:0擊敗赫塔菲，繼續向聯賽第三發起有力沖擊。
開場第三分鐘，科克開出任意球，托雷斯禁區內強力頭球命中。這是他回歸馬競以來打入的第壹記聯賽進球。上壹次托雷斯在西甲進球還要追溯到2006/07賽季。
馬競五月最佳球員公布 金童托雷斯賽季首次當選
馬德裏競技隊在官網宣布托雷斯憑借在5月份的出色發揮獲得球迷的支持獲得了馬競隊內5月最佳球員的榮譽，而這也是托雷斯回歸馬競後第壹次獲此殊榮。
馬競新球衣模仿雙冠賽季 托雷斯欣喜重披9號戰袍
2015年6月24日周三，馬競俱樂部正式公布了2015-16賽季的主場球衣。這款新球衣的設計類似於1995-96賽季，當時的馬競奪得雙冠王。而下賽季托雷斯則取代已經轉會去尤文圖斯的曼祖基齊，重新穿上馬競的9號球衣。
托雷斯馬競百球
北京時間2016年2月6日晚23點，2015/2016賽季西甲聯賽第23輪的比賽中，馬德裏競技坐鎮主場對陣埃瓦爾。比賽中馬競薩烏爾回傳失誤先丟壹球，隨後馬競通過兩個角球，兩中衛吉梅內斯和薩烏爾先後頭球建功反超，傷停補時階段替補登場托雷斯鎖定勝局，完成了個人馬競生涯第100個進球。
裏程碑！托雷斯代表馬競出戰300場
北京時間2016年3月7日淩晨西甲，馬競客場3-1戰勝瓦倫西亞，本場比賽是托雷斯代表馬競出戰的第300場比賽，曾經的金童用精彩的表現來迎接這壹時刻，本場比賽他打進壹球，還讓對手兩黃變壹紅下場。