1、功能不同。零錢通主要是壹款便捷的在線支付工具，支持微信零錢和銀行卡支付，用戶可以使用它進行日常消費、轉賬等操作；理財通則是壹種投資理財工具，用戶可以通過它購買貨幣基金、定期理財產品、保險產品、券商產品以及基金等多種理財產品。
2、投資風險和收益率不同。零錢通主要針對小額現金管理需求，其收益率相對較低，但風險也較低；理財通則主要針對投資理財需求，收益率相對較高，但風險也較高。
3、使用門檻和手續費不同。零錢通使用起來相對容易，無需門檻，也沒有手續費；理財通則則需要用戶進行實名認證和銀行卡綁定，且可能會產生壹定的手續費。
4、產品特點不同。零錢通具有支付、轉賬、收款、卡券等功能，其資金主要用來進行日常消費的支付和轉賬；理財通則主要以投資理財為主，提供多種理財產品的購買和服務。
5、安全性不同。零錢通與微信支付有相同的安全保障措施，采取了多層次的安全措施，如短信驗證、設備綁定等；理財通則由微眾銀行提供服務，其安全性也得到了確保。