1、農村商業銀行的性質是股份制商業銀行，而農村信用社屬於農村合作金融機構。
2、農村信用社是獨立的企業法人，而農村商業銀行是信用合作社的升級版。
3、農信社作為省聯社的發起人主要受省聯社監管，而農村商業銀行主要受銀監會監管。
4、信用社實行社員民主管理，而農村商業銀行以股東大會作為最高管理機構。