騾子唯壹的缺點是基本不能繁殖後代。它們多半沒有生育能力。只有極個別母騾與馬或驢交配後能生殖。
馬的染色體數是64條，驢的染色體數是62條，馬的卵子染色體數是32條，驢的精子染色體數是31條，通過精卵結合發育成的新個體——騾子的染色體數是63條。騾子性成熟以後，再形成精子或卵子時，每條染色體都沒有相對應的同源染色體進行配對，這樣每壹條染色體分到哪個配子裏是隨機的，就可能有馬的1條染色體和驢的30條染色體形成壹個配子，另壹個是1條驢的染色體和馬的31條染色體形成壹個配子；再由馬的2條染色體和驢的29條染色體形成壹個配子，另壹個是馬的30條染色體和驢的28條染色體形成壹個配子……依此類推，這樣就可以產生2^32（接近429 500萬）個不同類型的配子。在這些配子中，只有配子裏的染色體完全來自於馬的，或來自於驢的，這樣的配子才有生育能力。