1、定義不同：人民幣跨境支付系統是專司人民幣跨境支付清算業務的批發類支付系統，而SWIFT是指環球同業銀行金融電信協會，是壹個國際銀行間非盈利性的國際合作組織。
2、劃轉對象不同：SWIFT是壹個華爾街銀行設立的結算報碼中心，可以劃轉多種貨幣，而人民幣跨境支付系統僅能接受其他貨幣兌人民幣的結算和劃轉，如果是做非人民幣的結算。