首先從國債現貨的角度來看，我國的債券市場分為銀行間市場和交易所市場兩部分。其中銀行間市場是債券的“批發”市場，債券托管在中央國債登記結算有限責任公司（以下簡稱“中債登”），其主要品種包括國債、政策性銀行債、短融、中期票據、企業債等，采取櫃臺交易的方式運作，機構間通過相互詢價的方式完成交易，通常單筆交易的金額較大，其市場參與者均為機構投資者，交易量占我國債券交易總量的99%。
交易所市場則是債券的“零售”市場，在上交所和深交所交易，債券托管在中國證券登記結算中心。其主要品種包括國債、企業債、公司債等，采用集中撮合的方式進行交易，投資者在同壹交易平臺進行交易。通常單筆交易的金額較小，活躍品種也較少，交易量僅占我國債券交易總量的1%左右。
除了傳統的債券交易以外，我國也推出了債券ETF，如國泰基金推出的5年期國債ETF，以4～7年期國債作為標的，采取抽樣復制的方法進行對上證5年期國債指數的跟蹤。該ETF的出現能夠加強國債的流動性，促進銀行間、交易所兩個市場的互聯互通，也為個人投資者投資國債提供了新的渠道。
我國推出的2年期、5年期、10年期、30年期四個國債期貨合約，在中國金融期貨交易所（中金所）上市交易，采取與股指期貨同樣的撮合交易方式，屬於場內交易，其合約期限的選擇上采取3、6、9、12四個季月，選取最近的3個季月同時上市交易的方式。大部分投資者可以通過成為期貨公司客戶的方式參與交易國債期貨，由期貨公司代為進行清算、交割等，規模較大的銀行則有可能申請成為中金所會員，以特殊“自營會員”的方式參與國債期貨交易，自行進行國債期貨的清算、交割。