每個薄膜中的樣品數量與所用的塗膠系統有關。最常見的型號是10-15個樣品裝載孔，壹個孔是標記器，其余可以測量n-1個樣品。我最多用了25個洞。
可以在膜上測量幾種不同的蛋白質，這與目標蛋白質的分子量有關。如果蛋白質之間的條帶能完全分開，抗體特異性強，沒有混淆，就有可能檢測兩三種蛋白質。