1.時間限制不同。歷年賬戶余額是指若幹年的累計剩余余額，活期賬戶余額是指當年某壹年的累計剩余余額；
2.使用範圍不同。賬戶歷年結余可用於支付門急診的自付費用和附加基本支付後剩余的醫療費用。當年賬戶余額裏的錢可以用來支付門診、急診、院前急救和定點零售藥店的費用。
中華人民共和國社會保險法
第二十三條
職工應當參加職工基本醫療保險，用人單位和職工應當按照國家規定繳納基本醫療保險費。
無雇工的個體工商戶、未在用人單位參加職工基本醫療保險的非全日制從業人員以及其他靈活就業人員，可以參加職工基本醫療保險，個人按照國家規定繳納基本醫療保險費。第二十五條
國家建立和完善城鎮居民基本醫療保險制度。
城鎮居民基本醫療保險采取個人繳費和政府補貼相結合的方式。
享受最低生活保障的人員、喪失勞動能力的殘疾人、低收入家庭中60歲以上的老年人和未成年人等。將由政府補貼。