1.在套期交易期間，期貨價格與現貨價格的基礎水平和未來趨同性的變化。由於套利因素，期貨價格壹般接近交割日期的現貨價格，即基差約為零。所以基差的高低，基差變化的趨勢，套期保值清算的時間，決定了套期保值的風險和盈虧。
第二，影響持有成本的因素變化。理論上，期貨價格等於現貨價格加上持有成本，持有成本主要包括存儲成本、保險成本、資金成本和損失等。如果持有成本發生變化，基差也會發生變化，從而影響套期保值組合的損益。
3.保值風險資產和保值期貨合同的基礎資產之間的不匹配。2006年以前中國沒有豆油期貨合約。由於大豆價格與豆油價格波動的高度相關性，豆油生產者或消費者利用國內大豆期貨合約對豆油價格進行套期保值，這種套期保值稱為交叉套期保值。交叉套期保值的基差風險最大，因為它的基差由兩部分組成，壹部分來源於被套期資產的期貨價格和現貨價格的價差，另壹部分來源於被套期資產的現貨價格和被套期資產的現貨價格的價差。由於被套期風險資產與被套期期貨合約的標的資產不同，影響價格變化的基本因素也不同，導致交叉套期保值的基差風險相對較高。
4.期貨價格和現貨價格的隨機擾動。
由於以上四個原因，在套期保值組合的持有期內，基差不斷擴大或縮小，使得套期保值組合產生盈虧。在正常市場條件下，由於影響資產現貨價格的因素與期貨價格相同，套期保值基差的波動範圍相對較小，且穩定在壹個固定的波動範圍內，在這個波動範圍內產生的套期保值組合的盈利或虧損較小，因此不會對套期保值的有效性產生太大影響。但在壹些特殊情況下，市場上會出現不利於套期保值的異常情況，導致套期保值的基礎不斷擴大或縮小，從而造成套期保值組合的損失越來越大。如果止損不及時止損，會給套期保值者造成巨大損失。從概率上講，偏向正常基差水平的異常基差現象屬於小概率事件，但如果這種小概率事件的風險處理不當，套期保值會造成巨大損失。