1998年經營國內航線178條，國際和地區航線37條（其中國際28條），飛行12個國家和地區的21個城市。公司下設安徽、江西、山東、江蘇、太原、石家莊分公司和子公司，並與中國遠洋運輸總公司聯合組建中國航空貨運有限公司。東航占有70%的股份。1998年完成總周轉量15.5億噸公裏，旅客運輸量841.9萬人，貨郵運輸量24.3萬噸。1997年初，中國東方航空股份有限公司股票在海外上市，募集資金2.82億美元。10月，公司A股在上海證券市場上市，募集資金7.2億元。公司總股本48.67億股，61.6%由東方航空集團公司控制，5.54%為國內公***股，內部職員股占0.62%，海外股東持股32.2%。集團下屬獨資和合資企業30多家，經營航空維修、飯店、航空食品、旅遊、期貨交易、通用航空等。
機隊：59架。10架A300，5架A320，5架A340，MD-11F，13架MD82，5架MD-11，9架MD-90，5架福克100，6架波音737-300
總部：上海虹橋國際機場（200335）
中國南方航空股份有限公司是中國南方航空集團公司屬下航空運輸主業公司，總部設在廣州，以藍色垂直尾翼鑲紅色木棉花為公司標誌。有新疆、北方、北京、深圳、海南有限、黑龍江、吉林、大連、河南、湖北、湖南、海南、珠海直升機等13個分公司和廈門、廣西、汕頭、貴州、珠海等5家控股子公司；在廣州、北京、上海等地***設有17個國內營業部，在新加坡、東京、漢城、阿姆斯特丹、洛杉磯、悉尼、巴黎、沙迦等地設有38個國外辦事處。
中國南方航空股份有限公司是國內運輸飛機最多、航線網絡最密集、年客運量最大的航空公司。截止2005年底，南航經營包括波音777、747、757、737，空客A330、321、320、319、300在內的客貨運輸飛機247架。2005年，國際國內航線557條,通往全球142個大中城市。形成了以廣州、北京為中心樞紐，密集覆蓋國內，全面輻射亞洲，連接歐美澳洲的強大航線網絡。2005年，公司年旅客運輸量超過4400萬人次，進入世界航空客運十強行列，已連續26年居國內各航空公司之首。
中國南方航空股份有限公司飛行實力出眾，擁有2800多名優秀的飛行人員，是目前國內唯壹壹家擁有獨立培養飛行員能力的航空公司，與全球知名飛行模擬器制造商CAE合資建立的飛行訓練中心是國內規模最大的飛行訓練中心；機務維修實力雄厚，旗下廣州飛機維修工程有限公司（GAMECO）建有亞洲最大的飛機維修機庫，南航與德國MTU公司合建有國內最大、維修等級最高的航空發動機維修基地；保障體系完善，擁有獲得國家科技進步二等獎的飛行運行控制系統（SOC），以及同獲國家科技進步二等獎的發動機性能監控系統等國內航空業最為先進的IT系統。