u盤安裝的好處是讀取速度快，u盤裏的數據可以反復擦除，安裝文件可以隨時更改。缺點是由於u盤是可擦除的，有時殺毒軟件可能會將操作系統安裝文件中的文件誤認為病毒，容易導致文件刪除和安裝失敗。同時，u盤的啟動方式有很多種，設置比光盤稍微復雜壹些。
光盤安裝的好處是數據不會被破壞。壹般用CD-R或DVD-R光盤來安裝刻錄系統，刻錄系統只能寫壹次，數據壹旦寫入就無法修改，所以寫入光盤的操作系統不會因為誤操作或殺毒軟件而被破壞。但光盤本身的讀取速度通常低於u盤，光盤的存儲條件高於u盤。