財付通作為網上交易的信用中介，安全性倍受關註，故為了提升財付通賬號的安全性，防止用戶賬號密碼被木馬程序或病毒竊取，財付通推出了財付通安全控件，該安全控件實現了對關鍵數據進行加密工作。
財付通的信息都是實名制的。