1，不同來源
馬鈴薯澱粉的制備方法是將洗凈的馬鈴薯粉碎，過濾，沈澱，幹燥得到的沈澱物；玉米澱粉是用0.3%亞硫酸浸泡玉米，粉碎，過篩，沈澱，幹燥，研磨而成。
2、角色不同
馬鈴薯澱粉可用於制作透明度高的醬料，制得的醬料顏色透明，還可用於烹飪時的增稠。由於糊化溫度相對較低，可以減少高溫造成的營養和風味損失，用於增稠時可以最大程度地保證食材的原味。
玉米澱粉適用於肉類上漿。上漿後的配料軟滑嫩滑，能去除配料的異味，增強香味。適用於雞肉、鴨肉、魚蝦等質地較嫩或部位較嫩的菜肴，也可用於增稠。
3.不同的特點
馬鈴薯澱粉具有馬鈴薯的口感，吸水能力強，粘度足，顏色白，透明度好；玉米澱粉是壹種略帶黃色的白色粉末，有很強的吸濕性。
馬鈴薯澱粉的制作方法
馬鈴薯澱粉是制備培養基的主要原料。馬鈴薯澱粉在生產或實驗中的應用方式有兩種:壹種是將新薯(馬鈴薯)洗凈挖出芽眼，去皮後稱重。
取土豆200克，切絲，放入1000 ml水中煮15 ~ 30分鐘，稍涼，然後用四層紗布過濾，取濾液加水至1000 ml！這種使用馬鈴薯澱粉的方法應根據需要制作並用於種子生產。
另壹種方法是將去皮的土豆打成細漿，放入容器中，加水，混合均勻後用四層紗布過濾2-3次，濾液自然沈澱，沈澱後除去上清液，然後將所得澱粉薄薄地鋪在玻璃板上晾幹。
最後將充分幹燥的澱粉密封在容器中，以便以後需要制種時隨時取用。種子生產時，稱取20克澱粉，加入1000毫升水。該方法制備的馬鈴薯澱粉營養成分幾乎不被破壞。