新疆棉花目標價格補貼采取種植面積和籽棉交售量相結合補貼方式，其中，種植面積補貼占中央補貼資金60%比重，籽棉交售量占中央補貼資金比重40%。
當新疆市場價格低於當期公布的棉花目標價格（2014/2015棉季新疆棉花目標價格為19800元每噸），中央財政按照兩者差價和國家統計局統計的新疆棉花產量，核定全區補貼總額，並將補貼額壹次性撥付新疆自治區財政。再由新疆自治區財政逐級撥付到地方財政，按相關比例補貼兌付給農戶、相關單位。
市場早前多預計新疆會實行單壹“畝補”、或“量補”方式。此次，確定種植面積和籽棉交售量相結合補貼方式，顯示政策的平衡性考慮。側重“畝補”意味更強的可控性、操作性，以及有利於穩定棉花種植面積。
對於新疆棉花市場價格采價期，《方案》規定為9-11月。由於受年內氣候因素影響，2014/2015季新疆新棉集中上市較過往延後大約1個月左右時間，加上國家儲備棉8月底停止向市場投放。9月份國內棉花供應實際處於“青黃不接”時期。此時，棉花市場價格存壹定支撐，或無法體現新棉集中上市後，市場普遍擔憂的市場棉價大幅下跌狀況。
托底價格未明朗
國家層面已明確將制定托底預案，當國內市場棉花價格過度下跌，出現“賣棉難”時，將采取必要措施鼓勵企業入市收購穩定市場。
目前，市場最為關心的是，當國內棉價出現大幅下跌。國家“托底”預案的具體構成，以及“托底”價格選擇範圍。《方案》未明確“托底”預案，及托底價格區間。
受國家棉花庫存高位、下遊紡織業增長趨緩，以及2014/2015棉季中國實行棉花直補政策影響，棉花價格由市場供需決定，新棉集中上市被普遍預計將導致國內棉花價格大幅下跌。目前，國內棉花現貨價格為16000多元每噸，棉花期貨價格已下探至13000元-14000元每噸區間。
“托底”價格選擇範圍將直接關系到未來棉價走勢。以及決定國家2014/2015棉季最終的補貼額。
知情人士告訴大智慧通訊社，早前，相關部門曾認為“托底”價格在15000元每噸就夠了，但近期的棉價下跌，“托底”價格陷入新的爭論，
壹家棉花主流交易商則認為，相關部門應盡早確定“托底”預案，穩定市場信心。“如確定執行相關政策，預計“托底”價格出臺時間不會太晚。”
由於市場預期棉價將降，下遊紡織企業目前用棉基本處於“隨用隨買”狀態，多家紡織企業告訴大智慧通訊社，目前市場形勢下，企業層面都不敢補庫存，企業間棉花庫存維持低位。
“如果沒有托底政策，國內棉花現貨價格甚至可能壹路向下，跌至13000-14000元每噸。”某龍頭棉花交易商稱，“政府如盡早出臺托底價格，給市場壹個底部，將有助於刺激市場消費，紡企補庫存。”
紡企受益棉花市場化
《方案》獲批通過，棉花價格回歸市場供需，將有利於提升下遊紡織企業市場議價能力。
受國際棉價更大跌幅影響，國內外棉價差近期擴大至4000多元每噸。未來，國內棉價如大幅下跌，將有助於縮窄國內外棉價差，提升紡企國際競爭力，及降低紡織企業原料采購成本。
但國內棉花後續政策走勢尚未明朗，新疆棉花直補政策具體執行會有哪些問題，尚難評估。首次由國家收儲轉向市場供需決定的2014/2015季棉花市場，也面臨變數。
中國紡織工業聯合會副會長高勇稱，未來，國內棉價走勢可能會較“詭異”。“對棉價的判斷，需評估判斷政策未來走勢。”