首先，他們的行為目的不同。民間借貸行為具有明確的方向，往往用於生產經營等急需資金的特定用途，而非法發放貸款的行為人則以通過貨幣操作等金融手段獲取利益為目的，資金使用方向並不明確。
第二，兩者的行為對象不同。民間借貸的對象有特定的範圍，比如親戚朋友同事同學。壹般借貸法律關系是借貸雙方通過壹定的人際關系和社會關系形成的，而非法借貸行為是針對社會不特定對象的。
第三，兩者的利率正當性不同。民間借貸發生糾紛時，貸款利率低於同期銀行利率4倍的受法律保護，而非法借貸允許的高額回報不受法律保護。
民間借貸是指企業與自然人之間、非金融企業之間的合法債權債務關系；
違規發放貸款，是指銀行或者其他金融機構及其工作人員違反法律、行政法規的規定，向關聯方以外的人發放貸款，造成重大損失的行為。
參考資料:
百度百科-民間借貸？百度百科-非法發放貸款