連雲港市住房公積金管理中心是根據《國務院關於進壹步加強住房公積金管理的通知》(國發[2002]12號)的有關精神成立的。以營利為目的，直屬市政府副處級獨立事業單位，2003年4月投入運營。是負責管理連雲港市行政區域內各級行政機關、企事業單位和各行業單位及個人繳存的住房公積金的公共資金管理機構。其主要職責是:壹是編制和實施住房公積金歸集和使用計劃；二是記錄職工住房公積金的繳存、提取和使用情況；三是負責住房公積金的核算；四是審批住房公積金的提取和使用；五是負責住房公積金的保值和返還；六是編制住房公積金歸集使用計劃執行情況報告；第七，承辦住房公積金管理委員會決定的其他事項。
中辦下設5個職能部門，分別是催收管理部、貸款管理部、會計部、審計監察部、綜合部。2009年4月，新增城市業務部和東部城管部。按照屬地管理原則，在東海縣、贛榆縣、灌雲縣、灌南縣設立四個管理部，各管理部、中心實行統壹制度、統壹管理、統壹核算，具體負責各自職責範圍內的住房公積金管理工作。
中心成立以來，嚴格按照國務院《住房公積金管理條例》中“管委會決策、管理中心運作、銀行專戶存儲、財務監管”的原則，認真履行職責，加強住房公積金的管理和運營，努力維護廣大職工的合法權益，充分發揮了住房公積金制度的優勢，取得了良好的社會效益和經濟效益。截至2009年底，累計住房公積金62億元；累計提取住房公積金26億元；累計發放住房公積金貸款56億元，支持3.78萬戶家庭購房；大力支持城市住房保障。多次被江蘇省建設廳授予“江蘇省住房公積金管理先進單位”。